为了科学、有效地保护佛顶山森林生态系统、生物多样性为保护和利用提供科学依据,贵州省林业厅于1998年7-8月,组织了由贵州大学、贵州师范大学、贵州地质工程勘察院、贵州省林校、茂兰国家级自然保护区管理处、石阡县林业局和气象局等单位的专家、教授和科技工作者,组成了佛顶山自然保护区科学综合考察团,对该地区的地质、地貌、水文、气象、土壤、木本植物区系、森林生态、森林资源、珍稀濒危植物、中草药、大型真菌、地衣、鸟类、兽类、两栖类、爬行类、鱼类、昆虫、社会经济等学科进行了综合考察。 又用了一年多时间进行标本鉴定,样品分析,内业整理,结合历次调查材料,基本上查清了该区自然环境和生物资源,以及属于国家保护的动植物资源,共撰写20篇专题考察报告和综合考察报告,为该区的正确评价和自然保护区的区划及总体规划,以及今后保护管理和经营利用等奠定了基础。