蛋白质分子结构

第1章绪论
1.1引言.
1.2蛋白质在生命过程中的作用
1.3蛋白质结构的一般概念
1.4蛋白质的基本组成单位
1.5多肽链
1.6多肽链的构象
1.7蛋白质的结构生物学
第2章蛋白质的结构层次
2.1蛋白质的基本结构单位
2.2维持和稳定蛋白质高级结构的因素
2.3蛋白质的结构层次
2.4小结
参考文献
第3章蛋白质的一级结构和二级结构
3.1蛋白质的一级结构
3.2蛋白质的二级结构
参考文献
第4章蛋白质的超二级结构Motif
4.1连接多肽
4.2蛋白质中的超二级结构
4.3频繁发生的蛋白质超二级结构Motif类型
4.4超二级结构的结构特征描述
4.5简单的超二级结构Motif折叠组合成复杂超二级结构Motif
参考文献
第5章复杂超二级结构Motif与折叠子类(Folds)
5.1复杂超二级结构Motif折叠组合高级结构
5.2折叠子类
5.3折叠子与结构类型
参考文献
第6章蛋白质的三级结构与结构域
6.1蛋白质的三级结构
6.2结构域
6.3球状蛋白质和结构域的解剖学
6.4蛋白质(结构域)立体结构的比较
参考文献
第7章蛋白质的四级结构和蛋白质体系
7.1蛋白质的四级结构
7.2蛋白质体系
参考文献
第8章蛋白质晶体结构分析
8.1晶体结构分析简介
8.2蛋白质晶体学简介
8.3蛋白质晶体生长
8.4数据收集和处理
8.5同晶置换法
8.6分子置换法
8.7同晶差值傅里叶法
8.8电子密度图的计算和解释
8.9结构精修
参考文献
第9章多维核磁共振技术
9.1多维核磁共振方法确定蛋白质溶液三维结构的基本原理
9.2提取蛋白质结构信息的多维核磁共振方法
9.3蛋白质溶液三维结构的计算
参考文献
第10章蛋白质溶液构象的光谱技术
10.1紫外-可见差光谱
10.2荧光探针法
10.3圆二色谱..
10.4激光拉曼光谱
10.5红外光谱在研究蛋白质二级结构中的应用
参考文献
第11章蛋白质的二维结晶及结构重建
11.1蛋白质晶体的类型
11.2蛋白质的二维结晶化
11.3膜蛋白二维晶体形成的机制与条件
11.4电镜观察与三维结构重建
参考文献
第12章蛋白质结构的计算机图象分析与分子模拟技术
12.1计算机图形学
12.2图形显示设备
12.3图形系统和工作站
12.4生物大分子的分子模拟与计算机图形技术
参考文献
第13章蛋白质结构预测
13.1蛋白质结构预测概述
13.2正误构象的判断
13.3现阶段几种主要的简单评估函数方法
13.4基于知识的蛋白质结构预测.
13.5蛋白质的二级结构预测
13.6利用计算机互联网进行蛋白质结构预测
参考文献
第14章蛋白质结构研究中的几种数理方法
14.1遗传算法
14.2人工神经网络方法
14.3统计物理学方法
14.4一些数理方法算法的进一步讨论
参考文献
第15章蛋白质分子动力学
15.1分子动力学模拟方法
15.2经验力场和位能函数
15.3能量优化
15.4自由能计算
15.5模拟退火技术
15.6环境效应
15.7简振模分析
参考文献
第16章蛋白质工程与药物分子设计
16.1什么是蛋白质工程
16.2蛋白质工程领域的开创性工作
16.3蛋白质的改性及分子设计——当前蛋白质工程研究的热点之一
16.4基于生物大分子结构的药物设计——当前蛋白质工程
16.5蛋白质结构预测与药物分子设计
16.6尚待解决的问题和充满希望的前景
参考文献
第17章蛋白质的分子进化
17.1分子进化钟与中性理论
17.2功能相关的分子进化与非中性分子进化
参考文献
第18章酶分子的结构与功能
18.1酶分子的结构特点
18.2酶催化作用特点
18.3酶的分类和命名法
18.4酶的抑制作用
18.5调节酶
18.6羧肽酶A的催化功能和分子结构
18.7多酶复合物
参考文献
第19章蛋白质的分子运动
19.1蛋白质的结构生物学
19.2蛋白质分子的运动
19.3展望.
参考文献
第20章电子传递蛋白的结构与功能
20.1细胞色素c
20.2铁硫蛋白
20.3蓝色铜蛋白
20.4黄素氧还蛋白
参考文献...
附录用傅里叶变换方法进行三维重构的一般原理