计算机辅助药物设计导论

1 计算机在药学相关学科中的应用简介
1.1 计算机辅助教学
1.2 临床药学
1.3 计算机药品管理系统
1.4 仪器分析智能化
1.5 计算机辅助谱图解析
1.6 生物大分子的结构分析
1.7 计算机辅助合成路线设计
1.8 化学制药过程
1.9 数据源的共享、国际联检与计算机网络通讯
1.10 药物筛选自动化
1.11 计算机化学
1.12 组合化学
1.13 蛋白质工程
1.14 计算机辅助药物设计
2 药物设计的基本概念和理论基础
2.1 药物的化学结构
2.2 药物发现的途径与过程
2.3 药物作用的生物化学、细胞和分子生物学基础
2.4 药物作用的分子药理学基础
2.5 药物的化学结构与生物活性的关系(sar)
2.6 定量构效关系(qsar)
2.7 数据统计分析
2.8 三维定量构效关系(3d-qsar)
3 药物的化学信息计算机系统
3.1 二维化学信息管理软件
3.2 二维化学信息数据库
3.3 三维化学信息管理软件
3.4 三维化学信息数据库
3.5 合成反应信息管理软件及数据库
3.6 组合化学信息管理软件及数据库
3.7 微机支持的化学管理软件及数据库
3.8 其他化学智能计算系统
3.9 生物信息数据库和软件
3.10 药物的生物和化学信息网络资源
4 有关理论计算、技术和设备
4.1 理论计算基础
4.2 重要技术
4.3 计算机硬件和软件
5 计算机辅助药物设计的意义
5.1 计算机辅助药物设计的产生和作用
5.2 计算机辅助药物设计的特征
6 计算机辅助药物设计的方法学
6.1 直接药物设计
6.2 间接药物设计
6.3 组合化学与合理药物设计相结合的策略
6.4 用于计算机辅助药物设计的一些代表性软件
7 计算机辅助药物设计应用实例
7.1 用核磁共振和分子模型技术研究紫杉醇构象
7.2 抗流感病毒药物设计--基于唾液酸酶结构的直接药物设计
7.3 hiv蛋白酶抑制剂的设计--基于靶点结构的三维结构搜寻法直接药物设计
7.4 抗寄生虫药物设计--经同源蛋白模建和三维结构搜寻的直接药物设计
7.5 dhfr抑制剂的研究--受体受点的确定和原子生成法全新药物设计
7.6 ace拮抗剂的设计--计算机建立药效基团模型
7.7 肾素抑制剂的设计--药物作用模型分析和分子碎片法全新药物设计
7.8 5-ht3受体拮抗剂的研究--间接药物设计
7.9 hmg-coa还原酶抑制剂的设计--重叠体积法3d-qsar研究
7.10 als抑制剂的研究--qsar研究和药效基团模型法间接药物设计
7.11 ache抑制剂的研究和设计--qsar研究和药物作用模型分析
7.12 三唑类杀菌剂的设计研究--comfa法3d-qsar研究
7.13 口服凝血酶抑制剂的发现和开发--组合化学与基于结构的药物设计联用
7.14 组织蛋白酶d抑制剂的设计--组合化学与基于结构的药物设计相结合
7.15 抗sars冠状病毒药物的设计--生物信息学分析和虚拟筛选
8 结语 评价和展望
参考文献
9 附录
9.1 进一步参考和选读文献
9.2 主题词、软件名和药物名索引