药物分子设计

前言
第1章 绪论(1)
11药物的基本属性(1)
12药物与机体的相互作用(3)
121药剂相(4)
122药代动力相(4)
123药效相(5)
13新药的研究与开发(5)
131新药的研究阶段(5)
132新药的开发阶段(9)
14药物发展简史(10)
141以天然产物为主的发现时期(10)
142以合成药物为主的发展时期(11)
143药物分子设计时期(13)
144后基因组时代的药物分子设计(16)
15结语(18)
参考文献(19)
第2章 药物作用的基本原理和相关知识(20)
21药物受体的相互作用(20)
211影响焓变的相互作用(21)
212影响熵变的药物受体相互作用(23)
213药物受体结合的热力学(25)
22分子力学(25)
221力学效应(26)
222化学效应(28)
223原子类型(29)
23分子动力学(29)
24酶抑制剂(31)
241酶反应的特点(31)
242药物抑制的靶酶(32)
243酶抑制剂的作用环节(36)
244酶抑制剂分类(38)
25作用于受体的药物(43)
251受体的结构与分类(43)
252作用于受体靶标的药物——受体调节剂(46)
253配体受体相互作用的动力学分析(48)
254受体结合实验(49)
255药物受体的相互作用(50)
26作用于离子通道的药物(51)
261离子通道的基本特征(51)
262离子通道调节剂(52)
27核酸(52)
271核酸的基本结构(52)
272作用于核酸的药物(53)
参考文献(53)
第3章 分子的多样性——先导物的发现与优化(55)
31分子的多样性(55)
311分子多样性的表示方法(55)
312药物分子的结构多样性的生物学基础(57)
32天然生物活性物质——次级代谢产物(59)
321天然产物的防御和繁衍机制(59)
322次级代谢产物及其结构修饰(61)
33组合化学(73)
331组合化学的一般概念(73)
332组合化学原理(74)
333组合合成方法(75)
334以天然产物为模板合成化合物库(80)
34组合生物合成(85)
341原理(85)
342聚酮(86)
343肽类(88)
344其他(90)
35组合生物催化(91)
351原理(91)
352天然产物库(91)
353生物催化用于组合化学(95)
36虚拟筛选(97)
361基于受体结构设计组合库(97)
362组合库的设计(99)
363定向库(101)
364基于知识的化合物库(101)
37动态组合化学(106)
371一般原理(106)
372动态库的构建(107)
373举例(108)
38多组分反应(112)
381原理(112)
382多组分反应的特点和在合成上的优势(113)
383重要的多组分反应(115)
384多组分反应在新药研究中的应用(117)
385发现新的多组分反应的策略(118)
参考文献(121)
第4章 分子的互补性——先导物的发现与优化(128)
41分子识别与相互作用(128)
411静电作用能(129)
412立体作用(131)
413疏水作用(132)
414蛋白质配体相互作用中的溶剂作用(133)
42药物受体相互作用的基团贡献(134)
421基团贡献的加和性(134)
422平均结合能(135)
43药物受体相互作用及其原理(135)
431锁钥学说(135)
432诱导契合学说(136)
433受体构象群的稳定化——受体选择模型(136)
44基于受体结构的分子设计(140)
441基本概念(140)
442基于数据库搜寻的分子设计(147)
443全新药物分子设计(160)
444基于受体结构的组合化学库的设计(178)
45基于代谢产物的药物分子设计(180)
451引言(180)
452细胞色素P450(182)
453化学结构与氧化代谢的关系(183)
454基于代谢活化的分子设计(184)
455前药(186)
456利用载体分子内反应的前药(193)
457利用酶反应或特异性结合作用设计前药(197)
458逆代谢药物设计——软药(199)
46抗体药物(209)
461结构互补性——抗体抗原的相互作用(209)
462单克隆抗体药物(213)
463用作药物转释载体的单克隆抗体(216)
464基于单克隆抗体结构的分子设计(219)
465抗体导向酶催化前药疗法(222)
47高分子药物和高分子前药(229)
471引言(229)
472聚乙二醇化(229)
473HPMA共聚物作骨架(233)
474可生物降解的聚天然氨基酸(235)
475部位特异性高分子药物(235)
48基于片断的先导化合物的发现(236)
481基本原理(236)
482基于片断发现先导物的方法(237)
49手性药物(246)
491一般概念(247)
492手性药物的药代动力学(251)
493手性药物的药效学(258)
参考文献(261)
第5章 分子的相似性——先导物的发现与优化(276)
51分子的相似性(276)
511分子相似性的定义和内容(276)
512药物分子设计中的相似性原理和方法(277)
52同系物、不饱和性、合环和开环(279)
521同系物(279)
522不饱和键(284)
523合环与开环(287)
53生物电子等排(292)
531电子等排的一般概念(292)
532一价基团的电子等排体(293)
533二价基团的电子等排体(303)
534三价原子或基团的电子等排体(305)
535四取代原子的电子等排体(307)
536环与非环的电子等排体(308)
537Topliss决策法(311)
54过渡态类似物(315)
541原理(315)
542举例(315)
55酶自杀性底物(325)
551氨己烯酸和加巴苦林(325)
552依氟鸟氨酸(326)
553克拉维酸和舒巴克坦(328)
554司来吉兰(329)
555非那雄胺(330)
556谷胱甘肽S转移酶抑制剂(331)
56肽模拟物(332)
561肽类化合物的结构特征(332)
562肽模拟物(336)
563构象限制(337)
564非肽结构的肽模拟物(364)
57药效团(372)
571一般概念(372)
572药效团的表达方法(373)
573基于受体结合特征确定药效团——神经氨酸酶抑制剂(383)
58优势结构(384)
581基本概念(384)
582优势结构的特征(385)
583内源性物质的优势结构(390)
59基于配体分子的药物设计(405)
591组胺H2受体拮抗剂(405)
5925羟色胺受体调节剂(406)
593Ⅱb/Ⅲa糖蛋白受体拮抗剂(407)
594白三烯受体拮抗剂(409)
595P物质拮抗剂(410)
596维甲类化合物(411)
597甲氨蝶呤(413)
510挛药(414)
5101同挛药物(414)
5102异挛药物(415)
参考文献(417)
第6章 分子的相似性和互补性交汇——定量构效关系(436)
61二维定量构效关系(437)
611二维定量构效关系的基本原理(438)
612生物活性表示法(438)
62二维定量构效关系模型——Hansch藤田超热力学分析(439)
621线性自由能相关参数(440)
622首批化合物的合成和Hansch藤田分析的要点(458)
623Hansch藤田分析用于药物分子设计的实例(460)
624比较定量构效关系(468)
63FreeWilson模型(470)
631经典的FreeWilson模型(470)
632FujitaBan改良模型(475)
633FreeWilson模型与Hansch藤田方法的异同(477)
64分子连接性方法(477)
641原子的支化值——点价(478)
642分子连接性指数的计算(480)
643分子连接性指数的物理化学意义(483)
644分子连接性在QSAR分析中的应用(438)
645分子连接性指数与Hansch藤田分析的关系(484)
65三维定量构效关系(484)
651三维定量构效关系的一般特征(485)
652三维定量构效关系分析法(491)
653举例(498)
66全息定量构效关系(504)
661分子全息的生成(504)
662HQSAR模型表示法(505)
663举例(505)
参考文献(506)
第7章 药物分子设计的整合性(510)
71新药创制的价值链(510)
72结构优化(511)
73分子设计策略的整合性(511)
731药学性质的优化(512)
732药代动力学性质的优化(513)
733药效学性质的优化(514)
734安全性评价(515)
735虚拟筛选(515)
74分子设计方法的整合性(516)
参考文献(517)
附录药物化学名词(519)
索引(526)
后记(539)