《台湾基督教史》主要分为以下几个部分:荷据时期(1624年-1662年)、清朝统治时期(1858年-1895年)、日据时期(1895年-1945年)、战后时期(1945年-2001年),以及作为附录部分的台湾基督教大事记等相关内容。《台湾基督教史》以时间顺序为经,以重大事件为纬,在详实、准确记录台湾基督教历史的同时,也客观反映祖国大陆与台湾不可分割的历史渊源与民族情感 ,是一部集学术价值和社会价值于一身的佳作。基督教(新教)最早传入中国应自明末天启四年(公元1624年)荷兰新教在台湾传播开始。一部台湾基督教史从西方传教士用“手术刀”作为敲门砖,把“十字架”插到台湾岛之后,到20世纪末叶长老会利用“乡土神学”和“出头天”的神学来充当台湾政治的婢女时,人们可以看到,在很长的时间里政治与宗教就像一对双胞胎,一直陪伴着台湾基督教的传播与发展。此时,作为耶稣的信徒,当他们在翻开《圣经》上耶稣所说的“把凯撒的东西给凯撒,把上帝的东西给上帝”,不知作何理解?