生物降解和生物催化的一般概念1 11 术语的定义2 12 生物催化和生物降解的更多信息资源4 参考文献42 生物降解和微生物催化概念的发展史5 21 地球上生物降解的开端5 22 早期人类对生物降解和生物催化的观察7 23 早期生物降解科学研究和“自然发生说”的争论8 24 源于自然的微生物纯培养11 25 微生物代谢活动多样性研究的早期历史12 26 生物新陈代谢的同一性13 27 氧和加氧酶14 28 厌氧生物催化的历史17 29 分子遗传学和调控19 210 有机合成中的微生物22 211 概要23 参考文献233 通过富集培养和筛选确定新的微生物催化作用27 31 为什么使用富集培养？28 32 一般方法31 33 培养条件和培养基的选择34 34 筛选专一性生物催化反应34 35 概要35 参考文献364 微生物的多样性--有机化合物分解代谢的广泛分布41 41 微生物多样性的重要性41 42 真菌在生物催化和生物降解中的作用43 43 生物降解和生物催化能力在原核生物界的分布47 44 具有特异性代谢途径的微生物的特异性生物降解56 45 生物降解中的好氧微生物和厌氧微生物57 46 具有宽泛的分解代谢能力的代表性微生物58 47 生物降解中的同生菌65 48 全球生物降解和超级有机体的概念67 49 概要68 参考文献695 有机官能团的多样性：使生物化学的统一性相形见绌75 51 元素微生物的全球循环76 52 事实与谬误：天然产物与人工合成化学品及其生物降解78 53 一种有机官能团的分类80 54 自然界中发现的有机官能团83 55 自然界中发现的环状化合物89 56 有机官能团：对其生物降解和微生物催化，我们知道多少？ 92 57 概要94 参考文献946 生理过程：酶类、乳化、吸收和趋化性99 61 对环境化学物质的一般生理反应100 62 酶类101 63 酶底物专一性103 64 吸收--使底物接近酶107 65 乳化作用--提高基质有效性108 66 对有机溶剂抗性111 67 趋化性--趋向底物112 68 概要114 参考文献1147 分解代谢酶和代谢途径的进化121 71 历史122 72 微生物生物催化中的主要蛋白质家族124 73 进化原理在微生物分解代谢中的应用128 74 分解途径进化中的基因转移132 75 案例研究:酰胺水解酶蛋白家族中酶的进化134 76 概要139 参考文献1398 代谢逻辑理论和代谢途径图143 81 总述143 82 C1代谢图146 83 C2代谢图148 84 环烷烃代谢图150 85 BTEX代谢图：好氧代谢151 86 BTEX代谢图：厌氧代谢152 87 PAH代谢图153 88 杂环代谢图155 89 三嗪环代谢图155 810 有机卤化物代谢图156 811 金属有机物代谢图158 812 概要159 参考文献1609 微生物生物催化和生物降解的预测163 91 为什么预测生物降解途径是必要的？164 92 生物降解预测体系165 93 界定主途径167 94 界定与微生物分解代谢有关的有机官能团168 95 预测生物催化和生物降解的基础171 96 多于两个官能团：需要经验法173 97 概要175 参考文献17510 微生物的生物技术：化学品生产与生物修复177 101 历史进展和概念发展178 102 最近的趋势180 103 发酵终产物--药品181 104 微生物催化生产手性产物184 105 2,4-滴丙酸的手性合成185 106 非药物及非手性特殊化学品的生物催化186 107 废物再生的生物技术189 108 生物修复的实例研究--土壤中的莠去津191 109 概要195 参考文献19511 基因组学对微生物催化的影响199 111 基因组的大小和组成199 112 基因组学的当前影响207 113 微生物生物催化中的功能基因组学210 114 现代生物化学教科书中的疏漏213 115 逆向功能基因组学和生物催化作用新发现的事例214 116 概要214 参考文献21512 微生物催化作用和生物降解的范围：微生物是万能的吗？217 121 微生物酶的多样性218 122 实验提示新的生物催化反应是普遍存在的221 123 酶的可塑性和新的生物催化剂223 124 概要224 参考文献22413 重要问题和前景225 131 问题和对最终答案的一些看法225 132 摘要228附录229 A 与生物降解和生物催化有关的书籍和杂志229 B 生物降解和生物催化方面有用的因特网信息231索引235"
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