《南京大屠杀史料集》分若干专题,系统地介绍了有关南京大屠杀的重要史料,内容包括:中国军队为保卫首都南京与来犯日军进行顽强作战的历史档案材料;大量的侵华日军官兵的日记、书信、回忆和证言;一大批西方人士关于嘉峪关市大屠杀的文字史料;一批南京大屠杀幸存者的证言;远东国际军事法庭和中国国防部审判战犯军事法庭的史料等等,涵盖了大屠杀历史的各个方面,以无可辩驳的事实,向世人展示了当年的历史真相。本书搜集的是一批与南京攻击战、南京大屠杀相关的日本军方文件,这些文件包括军方最高层到日军基层部队的作战命令、战斗报告、阵中日志、作战计划、以及军方的电报、训示、通牒等等。本书收录的是日本军方文件均按照日军战斗序列排序。