关于会馆的起源,学术界有不同意见。有研究者把会馆的渊源追溯到汉朝的邸舍,何炳棣先生否定此论,他根据汉时已有外地在京师的同郡人宿歇之诸郡邸,便断定郡邸绝非明清以来会馆式之私人同乡组织,而更宜视作各郡驻京的办事处。明代史学家朱国桢在《涌幢小品》中说:“汉时郡国守相置邸长安,唐有进奏院,宋有朝集院,国朝无之。惟私立会馆,然止供乡绅之用,其迁除应朝者皆不堪居也”。综合历史记载和研究者意见可知,明代以后出现的会馆与过去的郡邸、进奏院、朝集院并不具有承上启下的传承式源流关系。汉代的邸舍等为官设机构,而明以后的会馆则纯属私设,是民间自发集结的商业性、联谊性活动场所。美国浸礼会传教士玛高温在其所著《中国的行会》一书中说:“会馆早在唐代就为人们所知了。”这种说法,不免过于夸大其实,它是将唐朝出现的某些行业组织视为会馆。其实,持这种看法的不仅仅是玛高温。日本学者加藤繁在《论唐宋时代的商业组织“行”并及清代的会馆》一文中称,自己就曾经有过相似的看法和认识,他说:在中国,有以会馆或公所等建筑物为中心而结合起来的、有几分类似欧洲中世纪的基尔特的商人组织,在清朝时代极为隆盛。从清末以来,虽然多少有些衰落,但是到现在还继续存在,这是世所周知的事情。这种组织的会员集会的建筑物称为会馆或者公所,因此,欧洲人等把这种组织就叫做会馆公所;又因为这种组织和欧洲的基尔特相似,也称为中国的基尔特……(我)在昭和二年(1927年)发表了题为《唐宋时代的商人组织——行》的论文,论证了应该看做会馆公所的先驱的商人组织在唐宋时代已经存在。以后又继续研究,结果,多少产生了些新的见解,也发现以前的考证的一部分中有着错误。在接下来的论述中,他对“行”这一概念作了新的解释:在唐宋时代,同业商人组织,叫做“行”。而“行”这一个词,同时又指同业商店的街区而言……从秦汉年间一直至唐代,在中国的都会里都规定了商业区域,至少在原则上商店应该设在这个地方,而把这种商业区域叫做“市”……因此,金银行、鱼行,都可以解释为各设于市内的金银商的街区和鱼店的街区。从上所述,可以窥知,在唐代,商店根据它的种类集合在一起,成为一团,把它叫做“行”,因此,当时中央地方的各个都市中的市,就是由好多的行形成的……在行内开设店铺的同业商店,自己也形成一种组织,它的组织也称为行。而属于这种组织的商人,叫做行人、行商、行户等