采用形态判别和RAPD分析相结合的方法研究分析了我国浙江、江苏、辽宁、天津和福建沿海等省市青蛤(Cyclina sineusis)地理群体的遗传变异和遗传结构。形态参数的聚类分析、主成分分析表明,五群体形态差异显著,江苏、辽宁和天津的形态较近,其中福建群体的趋异差异最大;RAPD分析显示青蛤遗传多样性较丰富,五个群体的多态度在O.249~0.307之间,平均为0.278,按递减依次为:江苏、福建、辽宁、浙江、天津;经分子方差分析(AMOVA),10.69%的遗传变异来自于群体间,89.31%来自于群体内;根据遗传距离,用UPGMA法进行聚类分析表明,浙江群体与江苏群体,辽宁群体与天津群体分别先聚在一起,最后与福建群体聚类;s11、$424、$228、$425 4个引物可以区分这五个青蛤地理种群,作为群体特征标记。青蛤形态学差异是'遗传和环境共同作用的结果,本研究结合形态和分子遗传学研究较准确地反映了青蛤五种群间的遗传特性,为今后种质资源保护及遗传育种提供依据。