教育中有一些基本问题是需要长期研究的，不仅仅因为它们的价值，也因为它们的开放性。在“八五”的基础上，“九五”教育研究对这些问题进行了深化研究。比如，关于教育性质与功能的研究，改革开放以来教育理论界一直关注这个问题，“九五”期间对此又进行了深化和拓展研究，具体表现在：从教育与社会关系的角度看，一是研究了社会整体纵向发展对教育提出的新要求，二是研究了教育与社会某一子系统（经济、政治、文化等）的关系。从教育与个体关系的角度看，研究主要集中在教育对人的发展的某种影响以及如何影响上。再如，教育思想史及制度史的研究摆脱了传统的思路，开始跳出个别教育家对教育思想流派、教育思潮、教育哲学进行宏观研究，结合中国文化传统和社会思潮的变迁，从教育理念的演变等更深层次上阐释中国教育思想发展的内在逻辑。其他如德育本质、德育目标、德育过程、大学使命、功能和作用、认知与学习、心理健康教育、高等教育体制改革研究、高校内部管理体制等，都在不同程度上形成了一些新的认识。
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