放线菌系统学：原理、方法及实践

前言
第一篇 放线菌系统学原理及实验方法
第一章 概论
　　1.1 放线菌在微生物系统学中的地位
　　1.2 放线菌生物学的发展
　　1.3 放线菌生物技术的发展
　　1.4 放线菌资源的开发与利用
　　主要参考文献
　第二章 放线菌系统分类学的过去和现在
　　2.1 国外概况
　　2.2 国内概况
　　2.3 几个值得重视的问题
　　主要参考文献
　第三章 形态特征和培养特征在分类中的意义
　　3.1 放线菌的基本形态
　　3.2 放线菌形态特征和培养特征的稳定性
　　3.3 形态分化的分子机制
　　主要参考文献
　第四章 生理生化特性
　　4.1 生理生化实验的内容
　　4.2 实验方法
　　4.3 API细菌数值鉴定系统
　　4.4 Biolog全自动和手动细菌鉴定系统
　　主要参考文献
　第五章 化学分类原理
　　5.1 细胞壁化学类型
　　5.2 全细胞水解物糖类型
　　5.3 磷酸类脂分析
　　5.4 醌组分分析
　　5.5 枝菌酸分析
　　5.6 脂肪酸分析
　　5.7 全细胞蛋白SDS-PAGE分析
　　5.8 核糖体蛋白双向凝胶电泳(2D-IPAGE)分析　
　　主要参考文献
　第六章 分子系统学原理及方法
　　6.1 核酸的提取、分离与纯化
　　6.2 聚合酶链反应
　　6.3 凝胶电泳技术
　　6.4 16S rRNA基因序列分析
　　6.5 DNA(G+C)mol％测定
　　6.6 DNA同源性分析
　　6.7 RNA同源性分析
　　6.8 DNA分子指纹分析
　　6.9 DNA探针及其应用
　　6.10 特异性引物应用于菌株的快速鉴别
　　主要参考文献
　第七章 生物信息学在放线菌系统学中的应用
　　7.1 提交序列到数据库
　　7.2 16S rRNA系统进化树的构建
　　7.3 RNA二级结构分析在分类学中的应用
　　主要参考文献
　第八章 多相分类
　　8.1 种的概念
　　8.2 属的概念
　　8.3 哪些菌株值得进行分类鉴定
　　8.4 放线菌分类鉴定的基本程序
　　8.5 有效发表的刊物
　　8.6 如何撰写论文
　　8.7 投稿
　　主要参考文献
第二篇 各论
　第一章 放线菌在原核生物中的地位
　　1.1 放线菌纲的建立
　　1.2 放线菌门的研究进展
　　主要参考文献
　第二章 放线菌亚目
　　2.1 放线菌科及主要属　
　　主要参考文献
　第三章 丙酸杆菌亚目
　　3.1 丙酸杆菌科及主要属
　　3.2 类诺卡氏菌科及主要属
　　主要参考文献
　第四章 微球菌亚目
　　4.1 微球菌科及各属
　　4.2 博戈里亚湖菌科及各属
　　4.3 短杆菌科及各属
　　4.4 纤维单孢菌科及各属
　　4.5 皮杆菌科及各属
　　4.6 皮生球菌科及各属
　　4.7 嗜皮菌科及各属
　　4.8 间孢囊菌科及各属
　　4.9 琼斯氏菌科及各属
　　4.10 微杆菌科及各属
　　4.11 原小单孢菌科及各属
　　4.12 稀有杆菌科及各属
　　4.13 血杆菌科及各属
　　4.14 阎氏菌科及各属
　　4.15 布登堡菌科及各属
　　主要参考文献
　第五章 棒杆菌亚目
　　5.1 棒杆菌科及各属
　　5.2 迪茨氏菌科及各属
　　5.3 戈登氏菌科及各属
　　5.4 分枝杆菌科及各属
　　5.5 诺卡氏菌科及各属
　　5.6 慢反应脂肪酸菌科及各属
　　5.7 冢村氏菌科及各属
　　5.8 威廉姆斯氏菌科及各属
　　主要参考文献
　第六章 假诺卡氏菌亚目
　　6.1 假诺卡氏菌科及主要属
　　6.2 束丝放线菌科及主要属
　　主要参考文献
　第七章 链霉菌亚目
　　7.1 链霉菌科及主要属　
　　主要参考文献
　第八章 链孢囊菌亚目
　　8.1 拟诺卡氏菌科及主要属
　　8.2 链孢囊菌科及主要属
　　8.3 高温单孢菌科及主要属　
　　主要参考文献
　第九章 小单孢菌亚目
　　9.1 小单孢菌科及主要属
　　主要参考文献
　第十章 弗兰克氏菌亚目
　　10.1 弗兰克氏菌亚目各科的系统发育关系
　　10.2 弗兰克氏菌科及主要属
　　10.3 嗜地皮菌科及主要属
　　10.4 中村氏菌科及主要属
　　10.5 鱼孢菌科及主要属
　　10.6 热酸菌科及主要属
　　10.7 “动孢菌科”及主要属
　　主要参考文献
　第十一章 糖霉菌亚目
　　11.1 糖霉菌科及主要属　
　　主要参考文献
　第十二章 未归类各属
　　12.1 双孢放线菌属
　　12.2 珊瑚放线菌属
　　12.3 卓孢菌属
　　12.4 佩尔泽氏菌属
　　12.5 苏黎世菌属　
　　主要参考文献
　第十三章 高温放线菌科
　　13.1 高温放线菌属
　　13.2 莱斯氏属
　　13.3 黄色高温微杆菌属
　　13.4 清野氏菌属
　　13.5 直丝菌属
　　主要参考文献
附录：放线菌科属名录