噬菌体展示：通用实验指南

第l章 噬菌体生物学及噬菌体展示简介
　1.1　简介
　1.2　丝状噬菌体生物学
　1.2.1　简介
　1.2.2　噬菌体颗粒的结构
　1.2.3　感染
　1.2.4　复制
　 1.2.5　基因和基因表达
　 1.2.6 噬菌体装配生理学
　 1.2.7 噬菌体装配机制
　1.3　噬菌体展示所使用的衣壳蛋白
　1.3.1　pⅧ蛋白
　1.3.2　pⅢ蛋白
　1.4　着手一个噬菌体展示项目
　1.4.1　展示的可行性
　1.4.2 筮菌体载体还是噬菌粒载体？
　1.4.3　多价展示还是单价展示？
　 1.4.4　辅助噬菌体
　1.4.5 篮菌体制备及定量的一般实验方案
　1.5　一个噬菌体展示项目的一般规则
　1.5.1　一个文库的生成
　 1.5.2　筛选
　 1.5.3　克隆的分析
　1.6　常见的问题
　 1.6.1　文库的质量
　 1.6.2　表达的编辑
　 1.6.3　过度筛选
　1.7　作为替代的展示系统
　1.8 筮菌体展示文库及试剂盒的商业来源
　参考文献
第2章　使用寡核苷酸定向诱变构建噬茵体展示文库
2.1　简介
2.2　文库设计的考虑
2.2.1　点突变
　 2.2.2　简并密码子的设计
　 2.2.3　理论的和实际的多样性
　2.3　定点诱变
　 2.3.1　定点诱变与盒式诱变的比较
　 2.3.2　寡核苷酸定向诱变的化学和生物学
　 2.3.3　无活性模板的构建
　2.4　文库的构建和保存
　 2.4.1　单链DNA模板的制备
　 2.4.2　异源双链CCC—dsDNA的体外合成
　 2.4.3　大肠杆菌的电转化和文库噬菌体的制备
　 2.4.4　文库的保存和再感染
　2.5　生物试剂
　参考文献
第3章　体外DNA重组
3.1　导言
3.2　体外DNA重组的本底
3.2.1　体外DNA重组在定向进化中的使用
3.2.2　体外DNA重组的应用
3.2.3　重组统计学
3.3　体外DNA重组的方法
3.3.1　Stemmer法
3.3.2 来自大肠杆菌的内切核酸酶V的DNA的随机片段化
3.3.3　随机引物重组
3.3.4　交错延伸程序
3.3.5　体外异源双链的形成和体内修复（异源双链重组）
3.3.6　重组方法的选择
3.3.7　本底的消除
3.3.8　技术要点
参考文献
第4章 为提高蛋白及多肽的亲和性及特异性的噬菌体筛选策略
4.1　简介
4.2　载体的考虑
4.2.1　单价和多价噬菌体展示
4.2.2　确保展示的成功
4.2.3　通过噬菌粒载体的蛋白质表达
4.2.4　载体的构建及噬菌粒的制备
4.3　文库的设计
4.3.1　硬随机突变
4.3.2　软随机突变
4.4　靶标的呈递
　　……　　
第5章　用噬菌体ELISA快速鉴定噬菌体展示蛋白的结合亲和性
第6章　使用重组肽库为受体识别新配体
第7章　底物噬菌体展示
第8章　从噬菌体展示文库中对稳定折叠的蛋白质及蛋白质结构域进行的基于蛋白酶的筛选
第9章　锌指结构与其他核酸结合性基序的噬菌体展示
第10章　噬菌体展示文库在体内及体外的筛选
第11章　利用血清筛选噬菌体文库
第12章　使用展示在噬菌体上的cDNA文库进行相互作用克隆
第13章　噬菌体抗体文库
第14章　噬菌体抗体的亲和力成熟
附录　普通供应商