基因表达分析手册：方法的实用性及其缺陷

上卷
第1章 基因表达的基本概念
　 1.1 引言
　 1.2 细胞内的转录与翻译
　 1.2.1 概述
　 1.2.2 转录
　 1.2.3 翻译
　 1.2.4 小结
　 1.3 转录调控
　 1.3.1 概述
　 1.3.2 mRNA表达谱——转录组（transcriptome）
　 1.3.3 蛋白质表达谱——蛋白质组（proteome）
　 1.3.4 基因和蛋白质的相互作用——互作组（interactome）
　 1.3.5 转录装置与核心启动子
　 1.3.6 调节启动子
　 1.3.7 增强子
　 1.3.8 基因座控制区
　 1.3.9 基质附着区
　 1.3.10 隔绝子
　 1.3.11 RIDGE曾强的基因表达区
　 1.3.12 增强子体
　 1.3.13 染色质
　 1.3.14 沉默子元件
　 1.3.15 转录因子、阻遏因子和辅助阻遏因子
　 1.3.16 表观遗传学
　 1.3.17 概括和总结
　 1.4 转录后调控
　 1.4.1 概述
　 1.4.2 RNA稳定性和降解的调控
　 1.4.3 转录延伸的调控
　 1.4.4 前体mRNA的差别/可变剪接
　 1.4.5 反式RNA剪接
　 1.4.6 mRNA转运的调控
　 1.4.7 定向的细胞 mRNA定位
　 1.4.8 mRNA聚腺苷酸化的调控
　 1.4.9 反式RNA
　 1.4.10 RNA编辑
　 1.4.11 小结
　 1.5 蛋白质的翻译后修饰
　 1.5.1 概述
　 1.5.2 蛋白质的酶促剪切
　 1.5.3 乙酰化
　 1.5.4 （聚）异戊二烯基化
　 1.5.5 甲基化
　 1.5.6 硫酸化
　 1.5.7 磷酸化
　 1.5.8 泛素化
　 1.5.9 糖基化
　 1.5.10 小结
　 1.6 mRNA与蛋白质表达的相关性
　 1.6.1 概述
　 1.6.2 mRNA水平和蛋白质的表达：相关性和差异性
　 1.6.3 小结
　 1.7 持家基因及内部和外部的标准
　 1.7.1 什么是持家基因
　 1.7.2 重要持家基因概述
　 1.7.3 其他常用的持家基因
　 1.7.4 新确定的维持基因
　 1.7.5 定量方法
　 1.7.6 小结
　 1.8 不同基因表达技术的分类
　 1.8.1 概述
　 1.8.2 从单个基因到转录组
　 1.8.3 分类的方法
　 1.8.4 小结
　 1.9 总结
　 1.10 参考文献

第2章 样品制备与辅助工具
　　2.1　引言
　　2.2　细胞和组织的制备
　　　2.2.1　免疫法纯化细胞
　　　2.2.2　差速离心/反向洗脱
　　　2.2.3　表面亲和层析
　　　2.2.4　密度梯度离心
　　　2.2.5　流式细胞术
　　　2.2.6　组织微分离技术
　　　2.2.7　各种细胞的分离和培养技术
　　2.3　核酸和蛋白质的制备
　　　2.3.1　概述
　　　2.3.2　总RNA和mRNA的分离
　　　2.3.3　分离前RNA的稳定性
　　　2.3.4　从培养的细胞和组织中制备蛋白质样品
　　2.4　总结
　　2.5　参考文献

第3章 mRNA表达的分析方法

下卷
　第4章 mRNA表达的高通量分析方法
　第5章 蛋白质表达分析
　第6章 原位和体内的mRNA及蛋白质表达分析方法
　第7章 计算方法和生物信息学工具