《农区生物多样性编目(上下册)》组织了包括26省(自治区)农业环境监测站和当地科学研究单位的专家进行协作,分别对有关农区生态系统与生境的9个领域开展实地调查研究,总计写出了702篇调查报告(即“条目”),比较全面地覆盖了我国农区的重要生态系统与生境分布区点,包括对生态系统状况、重要性、生物多样性受威胁情况与原因以及保护与合理利用措施的描述。除“条目”外,为了方便本《编目》使用者对各有关方面概况的了解,《农区生物多样性编目(上下册)》还开展了各领域和各省农区生物多样性概况的调查研究,主要使用2000年以来的最新资料,表述为第一章的全国概述、第二章的各省概述和各领域概述。《农区生物多样性编目(上下册)》还选编了与农区生物多样性保护与合理利用密切相关的附录资料,希望它能成为对我国有关农业和环境管理者、研究人员和监测者以及教学者有实用价值的工具。