卷一
太上灵宝净明道元正印经
太上灵宝净明四规明鉴经
太上灵宝净明中黄八柱经
太上灵宝净明洞神上品经
疏
衍
卷二
太阳元晶论
日月雌雄论
药母论
药物是非论
丹砂证道歌
圣石指玄篇
神室圆明论
金鼎虚无论
明堂正德论
疏
衍
卷三
飞仙度人经法
灵宝度人大法敷落五篇
太上灵宝净明法序
太上灵宝净明人道品
疏
衍
卷四
四时导引法势
十段锦
导引子午记
引导诀
六字诀
疏
衍
卷五
太上十二上品飞天法轮劝戒妙经
太上灵宝净明初真戒经
太上灵宝净明正真戒经
太上灵宝净明上真戒经
净明女真戒仪
净明在家奉持戒仪
疏
衍
净明三真科戒威仪
疏
衍
卷六
净明宗派
兰公上圣传
婴母传
旌阳许真君传
神烈吴真人传
正特陈真人传
元通周真人传
神会曾真人传
洪施时真人传
精行甘真人传
勇悟施真人传
潜惠彭真人传
和靖盱真人传
普惠钟离真人传
冲道黄真人传
景纯郭真人传
洪崖张真人传
净明护道金公地主传
许大真官传
胡詹二仙官传
白马忠懿传
洞真胡真人传
宗师吕真人传
法师白真人传
玉真刘真人传
中黄黄真人传
丹扃徐真人传
原阳赵真人传
长春刘真人传
涵虚朱真人传
逍遥张真人传
常住马真人传
疏
衍
卷七
真诠
真机应问
疏
衍
卷八
刘玉真真人语录
疏
衍
卷九
净明法藏图
性命双修起手说
性宗起手不运河车说
结胎有不在泥丸说
附:元神彰露微而望、望而晦说
疏
卷十
朝真礼斗经忏戒坛章奏等式
净明祈禳炼度科文
净明科仪早晚课诵
跋
附:如意仙丹方并净明堂诸方
净明院妙济神方引
都仙真君神功妙济方
净明堂神功妙济诸方目录
净明堂神功妙济诸方