长江口的生态环境问题一直受到高度的重视。由于全球海洋气候变化和流域环境变迁产生的叠加影响，使长江口区域的生态环境变得更为敏感和脆弱。近年来，中国水产科学研究院东海水产研究所围绕长江口的渔业资源和生态环境开展了大量的科学研究工作，尤其在上海市有关部门的支持下，与上海市长江口中华鲟自然保护区合作，对中华鲟保护进行了卓有成效的研究。他们的工作不仅取得了丰硕的科研成果，也越来越受到社会各界的广泛关注和认可。中华鲟是我国的国宝级鱼类。由于过度捕捞和栖息地破坏等多种原因，近几十年来该物种种群数量急剧下降，已处于十分濒危的状态，被列为国家一级水生野生保护动物。中华鲟是江海洄游性鱼类，繁殖在长江，生长在海洋，该物种的保护工作涉及长江流域和中国近海的广泛区域，是一个系统工程。长江口是中华鲟进行江海之间洄游的唯一通道，是幼鱼由淡水进入海洋前进行必要生理适应性调节的重要栖息地，还是幼鱼的重要索饵和生长场所。因此，长江口区域对中华鲟物种的保护至关重要，起着不可替代的作用。做好长江口中华鲟的保护工作尤为重要。
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