《我国城乡基本医疗保险一体化研究》综合采用了以下方法：一是定性分析与定量分析相结合的方法。在对中国城乡基本医疗保险一体化的研究过程中，对社会医疗保险的基本理论、中国城乡基本医疗保险的历史沿革、城乡二元医保格局的成因等分析以定性为主；而对城乡基本医疗保险的差异等分析以定量为主。二是多学科综合研究方法。在理论上，以经济学、政治学和社会学的基本理论和基本观点作为基础；在具体政策建议中，综合统计学、管理学和保险学相关知识提出建立和完善中国城乡基本医疗保险一体化制度框架的基本构想。三是实证分析与规范分析相结合的方法。《我国城乡基本医疗保险一体化研究》运用实证分析的方法对中国城乡社会保障制度的演变进行分析评价，尤其是选取我国东、中和西部三地区典型的城乡基本医疗保险一体化模式作为实证研究的例子来进行考察，以期描述我国城乡基本医疗保险的真实现状。从公平理论进行合理的过渡到健康公平理论，强调城乡基本医疗保险一体化进程中的公平取向，针对当前制度运行过程中出现的“碎片化”特征和城乡差距等现实问题，提出以健康公平为目标的城乡基本医疗保险改革策略和政策建议。四是比较分析法。通过对国外不同的医疗保障模式、制度架构、全民医保进程、城乡一体化整合和衔接竿进行分析比较，探讨全民医保发展运行的一般规律，吸取外国社会保障制度的教训，借鉴他们的有益经验，尤其是实行社会医疗保险模式的发达国家在市场经济运行机制下的管理方法等，同时对国内城乡基本医疗保险一体化试点创新和改革进行综合分析，以期从中寻找可借鉴的经验。
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