《物理学革命的哲学思考：寻找“科学统一性”方向的探索研究》提出了一个全面科学地评价理论的标准（即“C判据”），并将其作为建立理论时的指导思想，以便把哲学的指导作用具体化。根据“道法自然”和“阴阳根本律”，得出了两条基本结论，作为《物理学革命的哲学思考：寻找“科学统一性”方向的探索研究》的立论基础。以这两条结论为依据，考察了物理学的各领域，纠正了其一系列认识上的缺陷。由量子变分原理导出了非线性的系统结构动力学（SSD）方程，使“结构”成为了物质概念的一个维度，并将物种的“主动性”纳入方程之中。由SSD方程导出了薛定锷方程、牛顿方程和热力学基本方程，从而实现了经典、量子和热力学的初步统一。最后，又将SSD推广应用到生命科学领域，较成功地解释了活的生命自组织、生命自复制的动力学机制，以及意识和精神的物质性问题。并且由SSD方程推出了描述物种进化的“进化方程”，为正确理解生命“进化”以及华夏文明崛起的意义，提供了以自然规律为基础的一系列新的认识。
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