《生物化学实验指导书》共分为五大部分。第一部分生物化学实验技术与方法，简单讲述基础实验操作过程中常用的、基本的实验技术，如离心、盐析、分光光度、层析分离、电泳，并结合第二部分内容，将基础实验部分涉及的实验技术方法做了重点的介绍。第二部分基础生物化学实验，列举了包括糖、蛋白质、酶、核酸等经典验证性实验。第三部分应用实验，侧重综合运用知识能力的培养，列举一些关于食品方向的实验研究题目，旨在教师的指导下，锻炼学生能够根据研究题目的目的与要求，依据自己已有的知识，阅读查阅资料，尝试设计实验方案、分析实验结果，进一步提升自己的综合应用能力。第四部分个案分析，针对第二部分基础实验中某些实验出现的失败现象，分析常见问题以及可能造成失败的原因，为学生提供参考，以期学生能够通过实践真正自主提高自己的实验水平，这也是《生物化学实验指导书》的特色和亮点之一。第五部分附录，提供基础实验涉及的基础仪器设备操作使用、实验室安全、常用试剂配制等工具性知识。
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