《深入理解生态学:理论的本质与自然的理论(第二版)》围绕“生态学中众多的分支学科需要进行更好地综合”和“如何利用新工具的发展对生态学进行有效地综合”这两个主题,分四部分对生态学学科综合的必要性、生态学综合的方法路径、生态学理论到综合和应用、生态学理论发展及其环境等科学问题,从科学哲学的视野进行了系统论述。作者首先以回顾生态学自诞生至今100多年来所取得的巨大进步,以及在这一过程中所产生的发展障碍为切入点,阐释了理解的本质,理解的工具,证伪方法与应用在生态学综合过程中的作用;讨论了理论组分及理论建构条件、理论框架与等级结构等关系;论述了生态学理论变化的动因、理论组分发展的条件与理论成熟的关系,以及理论分类对生态学研究的重要价值;指出了新理论产生的5大价值及研究新范式、综合与整合对于不同的生态学研究范畴的意义;分析了目前生态学综合的客观性和局限性,提出了社会、公众和媒体对生态学发展的义务与责任。