《本草真诠》成书于万历三十年（1602）。共2卷，每卷分为3集。卷上一集讨论五运六气学说。二集讨论经络，并附十二经络图，三集讨论药性分类，列风、热、湿、燥、寒、气、血、痰、疮、毒、妇人、小儿十二门，门下分类，类下列药，每药简介功效主治，共载药1231种（包括重复药物）。卷下一集*列诸品药性阴阳论，继分温、热、平、凉、寒五类，每类药略述其畏恶、性味等，*后介绍了诸水之应用；二集为（食治门），分为米谷、菜蔬、果品、走兽、飞禽、虫鱼六类，收药141种，简介其功效主治；三集为用药杂论，主要摘取金元医家及本草序例中的相关内容，论述中医辨证用药必须注意的问题。本次整理以万历三十年（1602）建邑余良进怡庆堂刻本为底本。
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