《四库全书》是清代中期在朝廷主持下编纂的一部大型丛书，一直受到学术界的高度重视。《四库全书》系按传统的经、史、子、集四部分类，故以“四库”名书。医家类书籍收入子部。既往书志，包括史志在内，多将医家退之于子部末简。总纂官纪昀重视医书，认为“医虽一技，亦良命之所关，故升诸他艺术之上”，列于儒家、兵家、法家、农家之后，为子部笫五。《四库全书》所收医书共九十六种，以时代为序，始于《黄帝素问》，终于徐大椿《医学源流论》，包括了秦汉至清代乾隆中两千多年间重要的有影响的医经、方书、本草及临床诸科著作。其编纂十分注意考求版本，所收版本分别为敕撰本、内府本、永乐大典本、各省采进本、私人进献本、通行本等，精钞精校，且所收珍本甚多，向为医界推崇。
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