《常见疾病临床应用指南（中医药）/基层医疗卫生机构基本药物应用丛书》共分为十四个章节，主要参考《国家基本药物临床应用指南》的章节分布，包括呼吸系统疾病、消化系统疾病、心血管系统疾病、血液系统疾病、内分泌和代谢性疾病、神经系统疾病、风湿免疫性疾病、皮肤科疾病、泌尿系统与肾脏疾病、妇产科疾病、耳鼻咽喉科疾病、眼科疾病、肛肠科疾病、儿科疾病。将《国家基本药物临床应用指南》中感染性疾病章节下疾病融入到其它章节，结合基层临床实际需要，增加了肛肠科疾病和儿科疾病两个章节。《常见疾病临床应用指南（中医药）/基层医疗卫生机构基本药物应用丛书》按照“科学、严谨、简明、实用”的原则，以“西医辨病、中医辨证”的模式编写便于基层医疗机构全科医生参考使用，指导基层医疗卫生机构医生合理选用中药验方和中成药，促进临床安全合理使用中药，在基层试点实施推广使用国家基本用药，总结分析推广实施情况，为提出下一步有效推动中药基本药物管理的建议提供依据。
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