《X射线脉冲星自主导航理论与算法》简要介绍了X射线脉冲星的导航原理及国内外相关技术领域的发展现状;基于脉冲星计时观测领域的研究成果,归纳了面向导航的脉冲星计时模型;针对在轨情形设计了适应双星运动与航天器运动的相位估计与相位跟踪算法,以解决在轨动态情形下的脉冲相位与多普勒频移估计问题;研究了基于脉冲相位估计与多普勒频移估计的轨道确定与授时算法,进行了脉冲星导航算法的综合仿真验证;针对模糊度求解问题缺乏统一模型描述的情况,建立了模糊度接受域求解模型,并设计了PSO-CPMS搜索算法,有效提高了模糊度求解效率;最后对XPNAV-1卫星任务作了概述,介绍了X射线时间数据处理方法与数据分析软件系统。《X射线脉冲星自主导航理论与算法》具有较高的理论价值,给出的仿真分析为推进脉冲星自主导航技术的工程化提供了重要参考。