《针灸甲乙经》全书十二卷，共一百二十八篇，其内容大致为：卷一论脏腑、气血津液，卷二论经络，卷三论腧穴，卷四论脉诊，卷五论刺灸法，卷六论病因病机，卷七至卷十二论临床各科疾病的针灸治疗。如此按基础理论、经络腧穴、诊断、刺灸操作、临床治疗的编排次序，系统而有条理，对后世影响甚大。唐代《千金要方》《外台秘要》等有关针灸的内容多取材于《针灸甲乙经（第2版）/中医非物质文化遗产临床经典读本》，北宋官颁针灸腧穴专书《铜人腧穴针灸图经》也以《针灸甲乙经（第2版）/中医非物质文化遗产临床经典读本》第三卷为基础加以扩充而成。在唐代及稍后的日本、朝鲜等国医事律令中，《针灸甲乙经（第2版）/中医非物质文化遗产临床经典读本》均被列为中医学之必修教材。足显其在中医学中的经典地位。《针灸甲乙经》经由北宋校正医书局校勘，南宋以后刊刻较少。后世传本皆据北宋校定本。现存*早刊本是明万历吴勉学校勘的《医学六经》本，此本于万历二十九年（1601年）收入吴勉学校勘的《古今医统正脉全书》中，清以后有十余种刻本，新中国建立后又有影印本刊行。但后各家印本均以《医统正脉》本为祖本。此次校注工作亦以明刊《医统正脉》本影印本为底本。
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