本专著共分五章内容。*章为几何形态测量学简介，重点分析了传统测量的缺陷、几何形态理论、地标点和形态参数的分析方法，以及几何测量分析的基本步骤。第二章为几何形态测量在水生生物的应用，主要介绍几何形态测量简史、几何形态测量方法，以及、几何形态测量法在水生动物中的应用现状。第三章为几何形态测量法应用软件，主要介绍了目前国际上常用的TPS系列（TPSseriesofsoftware）、SHAPE、MorphJ、R语言程序相关加载包、PAST等5种方法。第四章为鱼类耳石的研究应用，以鱼类耳石为例，基于几何形态测量学对耳石形态学的生长研究，以及种类判别。第五章为头足类耳石的研究应用，以头足类的耳石为案例，基于外形轮廓法和地标点法的柔鱼类的种群进行判别。第六章为头足类角质颚的研究应用，以角质颚为材料，对柔鱼类、枪乌贼类的种类及其种群进行判别。
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