功能磁共振成像数据分析手册

1介绍 

1.1 功能磁共振成像的简要概述 

1.2认知神经科学的出现 

1.3功能磁共振成像分析简史 

1.4功能磁共振成像分析的主要步骤 

1.5 功能磁共振成像分析软件包 

1.6软件包选择 

1.7处理流程概述 

1.8 功能磁共振成像分析前提 

2图像处理基础 

2,1 图像是什么？ 

2.2坐标系．． 

2.3 空间转换．． 

2.4滤波和傅里叶分析 

3功能磁共振成像数据预处理． 

3.1简介． 

3.2 fMRI预处理概述． 

3.3 质量控制技术 

3.4变形校正． 

3.5层间时间校正 

3.6头动校正 

3.7空间平滑．． 

4 空间标准化 

4.1引言． 

4.2解剖差异． 

4.3 神经影像学坐标空间 

4.4 图谱和模板 

4.5解剖像的预处理 

4.6 功能磁共振成像标准化处理流程． 

4.7 空间标准化方法 

4.8基于表面的方法 

4.9选择一种空间标准化方法． 

4.10空间标准化的质量控制 

4.11标准化疑难解答．． 

4.12特定人群的标准化数据 

5统计模型：单样本分析 

5.1 BOLD信号 

5.2 BOLD噪声． 

5.3 实验设计和建模策略 

6统计建模：组分析 

6.1 混合效应模型 

6.2均值中心连续协变量 

7 图像的统计推断 

7.1 统计推断的基础知识 

7.2 图像中的感兴趣特征 

7.3 多重检验问题及解决方案．． 

7.4联合统计推断：掩码和联合效应 

7.5感兴趣区掩码的使用． 

7.6计算统计效力 

8大脑连接建模 

8.1 引言． 

8.2功能连接 

8.3有效连接 

8.4网络分析和图论 

9多体素模式分析和机器学习 

9.1模式分类介绍 

9.2分类器在fMRI数据中的应用 

9.3数据提取．． 

9.4特征选择． 

9.5训练和测试分类器 

9.6特征化分类器 

10可视化、定位、功能磁共振成像数据结果报告． 

10.1激活结果可视化． 

10.2激活定位 

10.3 定位和报告激活． 

10.4感兴趣区分析． 

附录A-般线性模型概述．． 

A．1 -般线性模型的参数估计． 

A．2假设检验． 

A.3 相关性和方差异性．． 

A．4使用一般线性模型的原因 

附录B数据的收集与管理 

B．1 功能磁共振成像分析的计算 

B.2数据结构 

B.3项目管理 

B．4编写数据分析脚本 

附录C图像格式． 

C.l数据存储 

C.2文件格式