《重大传染病规模化现场流行病学和干预研究：标准操作规程》是在《重大传染病社区综合防治实施方案和操作规程（试行版）》的基础上，由示范区项目技术执行办公室组织各课题组集体讨论并修订而成的。其内容涉及示范区信息调查、乙肝社区综合防治、艾滋病社区综合防治、结核病社区综合防治、重大传染病综合示范区防治质量控制。根据“十二五”现场研究经验，修订了部分表单，如在基本健康体检表中，增加了结核病、艾滋病筛查后的追踪确诊记录，要求对胸片疑似结核／未明确病灶性质者、HIV初筛阳性者予以明确诊断，并建立专项档案；与此同时，新增了部分表单，包括乙肝疫苗接种专项档案表、艾滋病高危队列（暗娟人群、男男同性性行为人群、感染者阴性配偶、吸毒人群）人组和随访表单等；并在新增的质量控制一章中，通过现场核查、实验室复核、信息平台数据比对等步骤，对项目的组织管理、过程实施、数据上传与结果产出等进行全面质量核查及改进，大限度保障“传染病防治综合示范区”项目严格按照操作规程执行。
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