第一章 蛋白质结晶前准备
第一节 目的蛋白质信息检索与调查
第二节 质粒制备
第三节 蛋白质纯化
第四节 蛋白质不表达和包涵体问题
第五节 蛋白质活性鉴定
第六节 蛋白质结晶前分析
第二章 蛋白质结晶与衍射数据收集
第一节 蛋白质结晶
第二节 蛋白质晶体衍射数据收集
第三章 蛋白质晶体结构解析软件安装
第一节 Linux系统安装
第二节 蛋白质晶体结构解析软件安装
第四章 Index、integrate与scale
第一节 一些晶体结构学知识
第二节 蛋白质晶体结构解析流程
第三节 Index和integrate
第四节 Scale
第五节 使用XSCALE功能进行scale
第六节 使用HKL2000进行index、integrate和scale
第五章 分子置换、构建优化与结构提交
第一节 分子置换
第二节 蛋白质晶体结构构建
第三节 蛋白质晶体结构优化
第四节 蛋白质晶体结构验证
第五节 蛋白质晶体结构提交到PDB
第六章 蛋白质晶体结构展示
第一节 pdb格式文件简介
第二节 PyMOL制作蛋白质晶体结构图
第三节 使用PyMOL制作蛋白质配体结合位点的信息
第四节 使用PyMOL调查蛋白质的温度因子B-factors
第五节 使用PyMOL重叠对比不同的蛋白质晶体结构
第六节 使用PyMOL显示蛋白质晶体结构中配体的电子密度图
第七节 PyMOL结合Chimera实现同时显示非对称单元的蛋白质分子
参考文献