遍主上师贡觉丹增活佛于藏历第十六胜生周的水兔年即公元1963年出生于藏区多麦地区,自幼具备坚定的信仰和深厚的慈悲。八岁时,前往拜谒热珠多吉强·土丹谢珠加措大师,大师非常高兴,给贡觉丹增活佛赐予吉祥哈达,使得贡觉丹增上师心中的经文传承和正法得到通达,发愿为佛法和众生完成大业。从此学习藏文读写等一学就通。十一岁时,在德格宗萨尔寺大亲教师堪钦·钦绕僧格尊前接受居士戒和沙弥戒,亲教师赐名土丹云丹加措。又在这位大亲教师尊前接受了《心滴前行》、《三宝总集》、《静猛狮三尊》、《意密精华集·上师修百明点》等的灌顶,聆听了《三宝总集》的指导,产生了厌恶轮回的出离心和利益众生的慈悲心。在化身伏藏师邬坚其巧尊前接受了《降魔忿怒莲花》和《小金刚橛》等灌顶,聆听了前行、正行、耳传、本净观修等,对所学没有停留在听闻和了解上,而是时时结合自心进行思维,使所学之法在心里得到纯熟。邬坚其巧上师见其所行非常高兴,遂收其为大弟子。二十岁时,徒步朝拜三大古寺等卫藏地区的名刹胜迹,并为了众生的幸福和佛法得以弘扬而发愿祈祷两个月。