深圳市水环境治理始终走在时代的前列。2005年以来，深圳市通过实施多项市政排水设施工程，采用“正本清源、截污限排、污水回用、生态补水”的水污染综合治理方案，实施截污工程，对多条河流进行了清淤，并新建了一批污水处理厂。深圳市围绕深圳湾流域水环境治理开展多项治水提质工程，涵盖河道治理工程、截排系统完善工程、管网建设工程和污水处理厂提标改造工程等。随着旱季污水收集、污水处理厂尾水提标改造等水环境治理措施的实施，雨季面源与截排溢流污染、珠江口外来污染和底泥内源释放成为新的环境问题。一方面，如何科学有效地提升深圳湾水质、保证深圳湾水生态健康，是深圳湾水环境治理的急迫问题；另一方面，经过长期的水环境治理和近期的水质达标攻坚战，深圳湾流域水环境形势发生了较大变化。鉴于此，面对深圳湾水质问题突出的严峻局面，有必要解析深圳湾流域水环境治理阶段性成效新背景下的深圳湾水质时空分布特征、主要污染源及其入湾途径与分布规律、深圳湾污染输移扩散特征及环境容量，全面厘清深圳市水环境治理相关措施与规划，有针对性地提出深圳湾主要污染源控制和削减的关键策略。与此同时，《深圳湾主要污染源溯源解析及控制措施》从海湾水质管理难度大等现实问题出发，探索性地提出基于地表水功能区和海洋功能区连接水域混合区的深圳湾水质管理模式建议，以期为粤港澳大湾区和深圳湾区经济建设保驾护航。
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