底本与校本。《刘铭传文献汇笺(套装上中下册)》以刊本《光绪朝朱批原件》、《宫中档光绪朝奏折》为底本,以中国第1历史档案馆藏《军机录副》与台北故宫博物院藏《军机处折件》为校本,并查照《明清台湾档案汇编》、《上谕档》、《清实录》等典籍,采用对校、理校、补正及考辨之法,逐件逐字对照,相互校勘。标点。《刘铭传文献汇笺(套装上中下册)》一律采用新式标点。校勘。以校本校底本,采用校勘、补正及考辨之法,逐字校勘,并于页脚出校。补正。对折件所涉之事件或文献,查找出处,并予以补录文字,以资参考;重要人物予以注释,相关文献全文照录,以保证文献的准确与完整。《刘铭传文献汇笺(套装上中下册)》按时间先后编排序号,并于标题下方附清帝纪年并公历日期,俾资查照。