余建军教授从2001/02到2002/12,在美国Lucent Technologies贝尔实验室任研究员。从2003/01到2005/10,在美国Georgia Institute of Technology任研究员和全光网络实验室主任。从2005/11到2010/02,在美国NEC Labs America任研究员、资深研究员。 从2010/03到2019/08,任中兴通讯北美光波所所长和中兴通讯高速光通信首席科学家(部分时间兼职)。从2011/06至今,任复旦大学特聘教授。2007年入选教育部长江特聘教授,2010年入选国家人计划A类q人才计划,2010年入选美国OSA Fellow, 2013入选国家自然基金杰出青年基金。