《个人所得税制纵深改革研究》共有十一个部分。首部分为绪论,介绍了我国个人所得税纵深改革的背景和必要性、国内外研究的现状、研究范围和方法以及本研究的创新与不足之处,其后是专著的主体部分。首章对个人所得税的基本理论进行梳理,阐释了公平和效率原则、个人所得税理论、单一税理论以及个人所得税累进程度研究。第二章概述了我国个人所得税制的沿革及存在的问题,分析了法律条文、税收负担、征税范围、优惠政策、计算方法、征管等方面存在的问题。第三章界定了三种四型个人所得税,分析它们的优缺点,确定选择个人所得税税制模式的原则——兼顾公平原则和效率原则。第四章从税收管辖权的概念入手,分析比较各国税收管辖权的实施情况,论述我国个人所得税管辖权存在的问题——居民税收管辖权实施范围太小,并指出改革方向:应坚持地域税收管辖权与居民税收管辖权并用的原则;居民纳税人的判定标准应改为,在我国境内有住所或没有住所,但在连续12个月内在我国境内居住183天及以上者。第五章首先介绍了应税所得的学说,其次探讨了应税所得的性质,对个人所得税的课税所得范围进行了国际比较,讨论了我国个人所得税课税范围的确定。第六章首先对各国个人所得税的纳税申报单位进行了分析比较,对个人所得税的费用扣除进行了国际比较,提出了“家庭”及“家庭系数”的确定原则、我国的生计费用扣除标准和各种所得的必要费用扣除的基本规定。第七章对个人所得税税率进行了国际比较,整理了60个国家的税率情况,重点介绍了英、美、日、德、法等发达国家及印度、巴西、保加利亚、泰国等部分发展中国家的税率及其演变情况。第八章对个人所得税征收管理进行了国际比较,分析研究我国个人所得税征收管理中存在的不足及其原因,提出个人所得税征收管理的配套措施:强化代扣代缴制度,将我国公民的居民身份证号码作为个人所得税的纳税人识别号,推进税务代理工作,实施个人财产实名登记制度,大力推进税收信息化建设,加强对较高收入者的收入监控等。第九章是在前几章研究的基础上,提出本专著研究的核心结果——交叉型分类综合个人所得税制度的设计。第十章为个人所得税制度设计其他方面的思考,如双重征税的消除。