《房山石经题记整理与研究(套装全3册)》是对北京图书馆金石组、中国佛教图书文物馆石经组编《房山石经题记汇编》(书目文献出版社,1987年)一书的再整理、补充与研究,并以此为工作底本,参照20世纪60年代北京图书馆金石组编《石经寺碑刻录》油印稿本,按照20世纪50年代石经开洞发掘时的最初状态,对石经山山上九个洞、山下云居寺地穴中的石经题记以及散落在寺内外的重要碑刻,依洞号和考古出土编号进行重新整理与排序。《房山石经题记整理与研究(套装全3册)》分为三卷,第1册为“题记卷”,分为“诸经题记”“洞外题记”“塔下诸经题记”“碑志塔幢”四大类,从而改变了初版《汇编》按照《大藏经》的排序。凡收录有题记的刻经760余种(房山石经刻经总数1110余种)、碑志塔幢铭刻等100余种。第二册为“研究卷”,收录了有关题记的着述,是房山石经题记研究成果的汇集。第三册为“图录卷”,首次从碑刻、题记的角度,选择隋唐辽金元明清各时期代表性刻经、碑志拓片800余幅,还收录了各时期书法精美的刻经、题记及碑石、拓片的局部特写以及线刻碑首造像和美术图案、有关云居寺石经山的新旧照片等。《房山石经题记整理与研究(套装全3册)》收录的题记、碑志,绝大部分均核对了拓片以及刻经图版,并注明题记出处。主要工作文本是中国国家图书馆善本部、云居寺文物管理处和北京市文物局资料信息中心珍藏的原始拓片资料,中国佛教协会、中国佛教图书文物馆编《房山石经》(30册,华夏出版社,2000年,以下简称“华夏本”)、中国佛教图书文物馆编《房山石经,辽金刻经》《房山石经·明代刻经》(23册,内部编印,1989-1994年,以下简称“佛协本”)以及中国佛教协会编《房山云居寺石经》(1册,文物出版社,1978年)。《房山石经题记整理与研究(套装全3册)》将石经题刻分为“题记”“题名”“发愿文”三类,按照“洞号+经名+朝代+人名+时间+类别”的规则和古籍整理的体例予以定名,时间不明的后加朝代。每洞的藏经,按照先出土编号为序;每种藏经,亦以出土编号为序。《房山石经题记整理与研究(套装全3册)》首次对唐辽金刻经中的“序跋”“发愿文”“偈语”等予以抄写、收录、句读,并核对了拓片。对题记、碑志择要做了按语。“图录卷”首次将唐代的10余种“巡礼题名碑”拓片刊出,并择要刊出孤本经、佚经以及经序的拓片和现场照片,从而使读者在利用《房山石经题记整理与研究(套装全3册)》题记时,能够更好地参考原始图版,掌握更多的考古信息。《房山石经题记整理与研究(套装全3册)》“附录一”将唐辽刻六百卷《大般若波罗蜜多经》题记按卷帙为次序排列,以展现石经山卷帙非常浩繁、内容非常丰富的刻经题记之面貌。“附录二”为唐刻《唐玄宗御注金刚般若波罗蜜经并序》(房山石经本)全文。“附录三”为辽刻《大唐贞元续开元释教录》(房山石经本)全文,均核对了拓片。