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基于高通量测序的基因组分析

基于高通量测序的基因组分析

定 价:¥108.00

作 者: 王峥峰 著
出版社: 科学出版社
丛编项:
标 签: 暂缺

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ISBN: 9787030721488 出版时间: 2022-06-01 包装: 平装
开本: 16开 页数: 160 字数:  

内容简介

  高通量测序已成为生物学研究的重要手段,在生物多样性、物种种质资源开发利用和生物医药领域都发挥了非常重要的作用,因此,如何处理和分析高通量测序数据成为生物学研究的必备技能之一。《基于高通量测序的基因组分析》以高通量测序数据在基因组分析中的运用为例,采用分步讲解的方式,图文并茂地介绍了高通量测序数据的基本格式,利用高通量测序数据开展分析的流程、相关程序,程序执行过程及其分析注意事项。同时,对于数据分析运算中的一些中间结果,作者提供了自己编写的程序,以利于获得*终结果。《基于高通量测序的基因组分析》提供了Linux操作系统安装方法,并基于Linux语言命令介绍了高通量测序数据处理过程,其中没有复杂的程序代码,不需要编程语言基础,浅显易懂,具有很强的实践操作性。

作者简介

暂缺《基于高通量测序的基因组分析》作者简介

图书目录

目录
第一章 Linux系统安装 1
第二章 Linux基本命令 6
第三章 高通量测序数据的常见格式 12
第四章 基因组组装 15
第一节 基因组大小估测  15
第二节 基于PacBio HiFi模式测序数据的基因组组装 21
第三节 基于PacBio CLR模式测序数据的基因组组装 27
第四节 基于Nanopore测序数据的基因组组装 30
第五节 去除基因组中的冗余序列 37
第六节 Hi-C组装 47
第五章 重复序列查找 66
第六章 基因预测 72
第七章 基因家族扩张和收缩  82
第八章 物种历史动态 100
第九章 群体重测序个体的SNP查找 110
第十章 遗传多样性参数计算 124
第十一章 受选择作用的SNP位点 129
第一节 PCAdapt分析 129
第二节 BayPass分析 135
第三节 合并PCAdapt和BayPass结果 140
第十二章 遗传结构分析 144
第一节 PCA分析 144
第二节 Admixture分析 146

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