摩尔根的《基因论》,为生物学实现新的理论综合奠定了坚实的基础,不但推动了细胞学的发展,还将生物学研究从细胞水平提升到了分子水平。《基因论》的出版问世,使得遗传学向生物学的其他学科渗透成为大趋势。其主要内容为:第一章到第四章,探究基因在染色体上的位置和作用,提出基因连锁群的概念及其交换机制;第五章到第六章,进一步研究突变性状的起源,探究突变性状和基因缺失之间的关系以及多等位基因;第七章到第十三章,主要是对由染色体数目的成倍增加所得来的单倍体、三倍体、四倍体、多倍体进行探讨,此外,还对因染色体不规则增减而出现的异倍体,以及种间杂交时染色体数目的变化进行了深入探讨;第十四章到第十七章,对性别决定机制、性中型以及性逆转进行论述;第十八章到第十九章,回顾全书,并得出基因具有高度稳定性这一浓缩性结论。