表观遗传学

目录
第1章　表观遗传学概论　1　
参考文献　3　
第2章　DNA甲基化　5　
2.1　DNA甲基化概述　5　
2.2　DNA甲基化与细胞记忆机制　7　
2.3　DNA甲基化模式的建立和维持　8　
2.4　DNA甲基化在基因表达调控中的作用　12　
2.5　DNA甲基化在哺乳动物中的主要功能　16　
2.6　DNA甲基化与疾病　19　
2.7　DNA甲基化相关问题与展望　23　
参考文献　24　
第3章　DNA去甲基化　28　
3.1　DNA去甲基化概述　28　
3.2　TET概述　35　
3.3　DNA去甲基化相关问题与展望　42　
3.4　DNA去甲基化研究面临的挑战　44　
参考文献　45　
第4章　基因组印记　51　
4.1基因组印记概述　51　
4.2　小鼠的印记基因　56　
4.3　基因组印记的调控　58　
4.4　印记基因群区的典型调控模型　65　
4.5　基因组印记的正常功能　67　
4.6　印记基因失常与人类疾病　69　
4.7　基因组印记的起源与进化　70　
4.8　总结与展望　71　
参考文献　72　
第5章　基因剂量补偿和X染色体失活　76　
5.1　性别决定与基因剂量补偿的概述　76　
5.2　哺乳类X染色体失活的发现与简介　80　
5.3　X染色体失活的动物模型与分子机制　84　
5.4　X染色体失活与人类疾病　89　
5.5　总结与展望　92　
参考文献　93　
第6章　组蛋白甲基化修饰　100　
6.1　蛋白质甲基化研究小史　100　
6.2　组蛋白甲基化酶的种类及催化的修饰类型　101　
参考文献　111
第7章　组蛋白去甲基化　117　
7.1　组蛋白去甲基化动态调控的研究历史概述　117　
7.2　组蛋白去甲基化酶的命名　121　
7.3　组蛋白去甲基化酶的生物学功能　123　
7.4　组蛋白去甲基化酶在制药领域的潜在应用　127　
参考文献　129　
第8章　组蛋白乙酰化　131　
8.1　组蛋白乙酰化的发现　131　
8.2　组蛋白乙酰化酶及其复合物　133　
8.3　组蛋白去乙酰化酶和抑制剂　138　
8.4　乙酰化识别蛋白　143　
8.5　组蛋白乙酰化的作用机制及功能　145　
8.6　组蛋白乙酰化与人体生理病理　150　
8.7　组蛋白乙酰化修饰与药物研发　152　
8.8　展望　153　
参考文献　154　
第9章　组蛋白其他修饰与组蛋白变体　162　
9.1　组蛋白其他修饰与组蛋白变体概述　162　
9.2　组蛋白磷酸化修饰　167　
9.3　组蛋白新型酰化修饰　170　
9.4　基于质谱检测的组蛋白修饰鉴定与定量分析　181　
9.5　组蛋白变体　187　
参考文献　193　
第10章　组蛋白修饰识别　206　
10.1　组蛋白修饰识别概述　206　
10.2　组蛋白修饰识别的分子基础　207　
10.3　组蛋白修饰识别的调控机制　210　
10.4　组蛋白修饰识别的生物学功能　212　
10.5　组蛋白修饰识别与染色质信号转导　215　
10.6　组蛋白修饰识别因子的鉴定方法与技术　218　
10.7　组蛋白阅读器靶向的药物研发　220　
参考文献　222　
第11章　染色质重塑　228　
11.1　染色质重塑概述　228　
11.2　核小体定位与基因调控　229　
11.3　组蛋白分子伴侣　233　
11.4　染色质重塑复合体　238　
11.5　染色质重塑与疾病　243　
参考文献　244　
第12章　染色质结构与组蛋白变体　247　
12.1　染色体结构　247　
12.2　组蛋白变体　254　
参考文献　261　
第13章　CTCF与三维基因组染色质高级结构　265　
13.1　CTCF与DNA的相互作用　265　
13.2　CTCF与黏连蛋白协同架构三维基因组染色质高级结构　270　
13.3　CTCF与染色质高级结构　272　
13.4　CTCF与基因表达调控　275　
13.5　总结与展望　283　
参考文献　285　
第14章　Polycomb复合物及Trithorax复合物　289　
14.1　Polycomb复合物和Trithorax复合物概论　290　
14.2　Polycomb复合物　293　
14.3　Trithorax复合物　302　
14.4　Polycomb复合物和Trithorax复合物相关抑制剂　308　
14.5　总结与展望　309　
参考文献　310　
第15章　DNA甲基化修饰酶的结构生物学研究　315　
15.1　DNA甲基转移酶　315　
15.2　DNA去甲基化调控酶　323　
参考文献　326　
第16章　非编码RNA　330　
16.1　非编码RNA概述　330　
16.2　非编码RNA种类　332　
16.3　非编码RNA特征、产生及生物学功能　332　
16.4　非编码RNA与疾病　340　
16.5　研究非编码RNA的方法学　342　
16.6　总结与展望　344　
参考文献　345　
第17章　siRNA　348　
17.1　RNAi概述　348　
17.2　siRNA的加工生成　349　
17.3　RNAi的调控机制　353　
17.4　RNAi引起的毒副作用　358　
17.5　RNAi药物的前景与挑战　360　
参考文献　362　
第18章　RNAa　365　
18.1　RNAa概述　365　
18.2　外源性RNAa　368　
18.3　内源性RNAa　372　
18.4　线虫中的RNAa　374　
18.5　RNAa的应用　375　
18.6　RNAa领域面临的问题与展望　376　
参考文献　376　
第19章　microRNA概述　381　
19.1　miRNA的概况　381　
19.2　miRNA的生物合成　384　
19.3　miRNA的作用机制　392　
19.4　miRNA数据库简介　397　
19.5　miRNA的功能与疾病　399　
19.6　miRNA与疾病诊断和治疗　410　
参考文献　414　
第20章　NamiRNA　423　
20.1　miRNA概述　423　
20.2　增强子与miRNA的关系　426　
20.3　NamiRNA通过增强子介导基因的激活　428　
20.4　NamiRNA作用机制　430　
20.5　NamiRNA研究的展望与挑战　431　
参考文献　434　
第21章　piRNA436　
21.1　piRNA的发现、分类与生成　436　
21.2　piRNA通路的功能及作用机制　440　
21.3　piRNA机器的代谢　445　
21.4　piRNA与男性不育　445　
21.5　总结与展望　446　
参考文献　446　
第22章　lncRNA　447　
22.1　lncRNA的发现和定义　447　
22.2　lncRNA的鉴定、种类与特征　448　
22.3　lncRNA的表达与转录后加工　451　
22.4　lncRNA的调控机制　453　
22.5　lncRNA的生理功能　459　
22.6　lncRNA与肿瘤465　
参考文献　467　
第23章　环形RNA　475　
23.1　环形RNA的发现　475　
23.2　环形RNA的基本分类　477　
23.3　环形RNA的自身代谢　478　
23.4　反向剪接环形RNA的生物学特征　481　
23.5　反向剪接环形RNA的功能　483　
23.6　环形RNA与疾病　485　
23.7　环形RNA研究展望　486　
参考文献　486　
第24章　RNA修饰　490　
24.1　RNA修饰简介　490　
24.2　RNA修饰分布特征　495　
24.3　RNA修饰的生物学功能　500　
24.4　RNA修饰与生理病理效应　505　
24.5　总结与展望　510　
参考文献　511　
第25章　RNA编辑　515　
25.1　RNA编辑概述　515　
25.2　RNA编辑的分类　516　
25.3　RNA编辑的定位和定量　520　
25.4　动物中RNA编辑的功能　521　
25.5　植物中RNA编辑的功能和意义　532　
25.6　RNA编辑的应用　536　
25.7　总结　537　
参考文献　537　
第26章　DNA甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA的互动与协调　544　
26.1　DNA甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA的相互关系和调控概论　544　
26.2　DNA甲基化与组蛋白修饰　546　
26.3　非编码RNA与DNA甲基化　548　
26.4　非编码RNA与组蛋白修饰　550　
26.5　DNA甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA三者之间的悖论和挑战　554　
参考文献　557　
第27章　表观遗传学与基因可变剪接　561　
27.1　基因可变剪接的功能和生物学意义　561　
27.2　基因可变剪接的经典调控　565　
27.3　组蛋白修饰与基因可变剪接　568　
27.4　DNA甲基化与基因可变剪接　570　
27.5　研究展望　572　
参考文献　573　
第28章　染色质的空间结构与功能学意义　576　
28.1　细胞核与染色质的空间组织架构　576　
28.2　解析染色质　3D结构的方法　581　
28.3　发育过程中动态变化的染色质结构　584　
28.4　疾病情况下改变的染色质形态　586　
28.5　总结与展望　589　
参考文献　590　
第29章　增强子与细胞身份　595　
29.1　增强子的概念与定义　596　
29.2　增强子的表观遗传学特征　596　
29.3　增强子序列变异及突变与疾病　602　
参考文献　603　
第30章　表观遗传信息的遗传　607　
30.1　表观遗传信息的遗传概述　607　
30.2　表观遗传信息的跨代传递　608　
30.3　有丝分裂中的基因书签　615　
30.4　总结与展望　623　
参考文献　625　
第31章　表观遗传与遗传的相互作用　629　
31.1　SNP与基因表观遗传调控区域的关系　629　
31.2　表观遗传修饰改变与拷贝数变异　633　
31.3　唐氏综合征的表观遗传异常　635　
31.4　遗传与表观遗传学共同决定人的性状　638　
参考文献　643　
第32章　表观遗传学与生殖　649　
32.1　生殖过程概述　649　
32.2　精子发生和成熟的表观遗传特征　651　
32.3　卵子发生和成熟中的表观遗传调控　662