《理性时代》分两个部分, 第一部分主要涉及耶稣和他的历史、基督神学和真正的神学、《圣经》的属性、论基督教义对教育的影响以及改革建议、基督教义和自然神论的宗教教义之比较等;第二部分通过《旧约》与《新约》对《圣经》提出了文本上的质疑。潘恩所倡导的理性恰恰是人类社会稀缺的资源,不论过去、今天还是未来都需要人们警醒。正如潘恩在本书开头所言:“理性是解决所有问题最有效的武器。我从未并且也绝不会尝试使用其他方法。”潘恩在书中基于“自然神论”的观点,揭露了形形色色宗教的所谓“天启”的无稽。他认为“世界本身就是天启,宇宙万物就是神谕”,神是作为非人格的始因而存在,并不能支配自然和社会生活。潘恩揭穿了宗教欺骗人类的三种手段:神秘、奇迹、预言,并指出一切荒唐古怪的宗教都是在人类抛弃了理性的作用才产生的。