益生凝结芽孢杆菌研究与应用

章绪论1
节芽孢杆菌概述1
一、芽孢杆菌的简介1
二、芽孢杆菌的种类1
第二节凝结芽孢杆菌概述4
一、凝结芽孢杆菌的相关研究4
二、凝结芽孢杆菌的结构4
三、凝结芽孢杆菌的特性6
四、凝结芽孢杆菌的作用7
参考文献8
第二章凝结芽孢杆菌的筛选与鉴定12
节凝结芽孢杆菌的筛选12
一、筛选标准14
二、BC9951的筛选16
三、BC99和BC66的筛选20
第二节凝结芽孢杆菌的鉴定22
一、BC9951的形态学鉴定23
二、BC99和BC66的形态学鉴定28
第三节凝结芽孢杆菌的保藏30
参考文献31
第三章凝结芽孢杆菌的高密度发酵工艺34
节凝结芽孢杆菌的退化预防、复壮和活化34
一、凝结芽孢杆菌的退化预防34
二、凝结芽孢杆菌的复壮35
三、凝结芽孢杆菌的菌株活化35
第二节凝结芽孢杆菌的发酵条件优化36
一、种龄36
二、初始pH37
三、温度38
四、转速39
五、接种量40
第三节凝结芽孢杆菌的发酵培养基优化41
一、碳源的筛选及浓度试验41
二、氮源的筛选及浓度试验42
三、无机盐的筛选及浓度试验43
四、发酵培养基配方的响应面优化44
五、发酵过程优化——糖的补加工艺49
参考文献53
第四章凝结芽孢杆菌芽孢形成和萌发55
节凝结芽孢杆菌的芽孢形成55
一、凝结芽孢杆菌的芽孢化启动55
二、凝结芽孢杆菌芽孢化启动通路的调控机制58
三、凝结芽孢杆菌芽孢化启动通路及相关调控的构建62
四、基于全基因组测序的凝结芽孢杆菌芽孢形成及调控分析63
五、凝结芽孢杆菌芽孢形成的影响因素64
第二节凝结芽孢杆菌的芽孢萌发75
一、芽孢萌发过程75
二、凝结芽孢杆菌芽孢萌发的影响因素76
参考文献77
第五章凝结芽孢杆菌的环境生理学82
节凝结芽孢杆菌对酸胁迫的响应83
一、细菌的耐酸调控机制83
二、酸胁迫下凝结芽孢杆菌的生长与存活85
三、基于全基因组测序的凝结芽孢杆菌耐酸机制分析92
四、凝结芽孢杆菌对酸胁迫的响应机制93
第二节凝结芽孢杆菌对胆盐胁迫的响应101
第三节凝结芽孢杆菌对温度胁迫的响应102
第四节凝结芽孢杆菌对其他胁迫的响应105
一、凝结芽孢杆菌对氧胁迫的响应105
二、凝结芽孢杆菌对抗生素胁迫的响应105
三、凝结芽孢杆菌对水分胁迫的响应106
参考文献107
第六章凝结芽孢杆菌的代谢产物112
节凝结芽孢杆菌与抑菌物质112
一、细菌素类抑菌物质112
二、有机酸类抑菌物质114
三、凝结芽孢杆菌的抑菌特性115
四、凝结芽孢杆菌与有机酸120
五、凝结芽孢杆菌与细菌素122
第二节凝结芽孢杆菌与乳酸129
一、微生物发酵法合成乳酸129
二、凝结芽孢杆菌与乳酸130
第三节凝结芽孢杆菌与短链脂肪酸132
一、SCFA的生成132
二、凝结芽孢杆菌与SCFA133
第四节凝结芽孢杆菌与酶类133
一、凝结芽孢杆菌与β-半乳糖苷酶133
二、凝结芽孢杆菌与α-半乳糖苷酶134
三、凝结芽孢杆菌与其他水解酶类134
参考文献135
第七章凝结芽孢杆菌的组学研究142
节凝结芽孢杆菌基因组学研究142
一、凝结芽孢杆菌P38基因组分析144
二、凝结芽孢杆菌Hammer（ATCC 7050;DSM1）基因组分析145
三、凝结芽孢杆菌36D1基因组分析145
四、凝结芽孢杆菌2-6基因组分析146
五、凝结芽孢杆菌CGMCC 9951基因组分析153
六、凝结芽孢杆菌MA-13基因组分析154
七、凝结芽孢杆菌LBSC(DSM 17654)基因组分析155
八、益生菌凝结芽孢杆菌HM-08基因组分析157
九、凝结芽孢杆菌HS243基因组分析158
十、凝结芽孢杆菌S-lac基因组分析167
十一、凝结芽孢杆菌ZB29基因组分析171
十二、凝结芽孢杆菌NL01基因组分析172
第二节凝结芽孢杆菌次级代谢挖掘与泛基因组分析172
一、ANI值和DDH值分析和基因组系统发育分析172
二、核心基因组和泛基因组分析173
三、次级代谢产物合成基因簇173
第三节凝结芽孢杆菌转录组学研究178
一、凝结芽孢杆菌温度胁迫转录组学分析178
二、凝结芽孢杆菌CGMCC 9951芽孢形成转录组学分析178
三、乳酸钠和乳酸钙对凝结芽孢杆菌2-6转录调控分析184
四、凝结芽孢杆菌R11对铅胁迫转录组分析189
第四节凝结芽孢杆菌蛋白质组学研究191
一、凝结芽孢杆菌BCS13002产乳酸的蛋白组学分析191
二、凝结芽孢杆菌2-6蛋白组学分析195
参考文献197
第八章凝结芽孢杆菌的生理功能及其作用机制202
节医用凝结芽孢杆菌生理功能及其疾病防治机制202
一、调节微生态平衡202
二、增强肠道屏障203
三、调节宿主代谢203
四、增强免疫功能204
第二节饲用凝结芽孢杆菌生理功能及其作用机制204
一、促进动物消化吸收，提高动物生长性能204
二、优化肠道微生物区系组成205
三、增强动物免疫功能206
第三节农用凝结芽孢杆菌生理功能及其生物防治机制206
第四节具有优良生理功能的凝结芽孢杆菌207
一、凝结芽孢杆菌TBC-169207
二、凝结芽孢杆菌ATCC 7050209
三、凝结芽孢杆菌IS-2(ATCC PAT-11748)209
四、凝结芽孢杆菌SCC-19210
五、凝结芽孢杆菌GanedenBC30(GBI-30)210
六、凝结芽孢杆菌CGMCC 9951211
七、凝结芽孢杆菌BC99213
八、凝结芽孢杆菌BC66215
参考文献215
第九章凝结芽孢杆菌的应用222
节凝结芽孢杆菌与医药行业222
一、凝结芽孢杆菌与肠道健康224
二、凝结芽孢杆菌与衰老226
三、凝结芽孢杆菌与呼吸道疾病227
四、凝结芽孢杆菌与高血压、高血脂228
五、凝结芽孢杆菌与皮肤疾病228
六、凝结芽孢杆菌与妇科疾病229
七、凝结芽孢杆菌与类风湿疾病229
第二节凝结芽孢杆菌与食品行业230
第三节凝结芽孢杆菌与养殖行业231
一、凝结芽孢杆菌与畜类行业231
二、凝结芽孢杆菌与禽类行业232
三、凝结芽孢杆菌与水产行业234
四、凝结芽孢杆菌在生物饲料中的应用235
第四节凝结芽孢杆菌与生物农药236
第五节凝结芽孢杆菌与发酵工业237
一、凝结芽孢杆菌生产酶制剂237
二、凝结芽孢杆菌生产有机酸238
三、凝结芽孢杆菌生产细菌素238
参考文献238