番茄基因组设计育种

前言
1 番茄智能型育种面临的主要挑战
1.1 番茄产量
1.2 番茄果实品质
1.2.1 番茄果实营养品质
1.2.2 番茄果实感官品质
1.2.3 适度胁迫对番茄果实品质的影响
1.3 番茄对生物胁迫的抗性及对非生物胁迫的耐受性
1.3.1 番茄对生物胁迫的抗性
1.3.1.1 番茄病虫害的种类
1.3.1.2 气候变化对番茄病虫抗性的影响
1.3.1.3 番茄对新病虫害的抗性
1.3.2 番茄对非生物胁迫的耐受性
1.3.2.1 水分胁迫
1.3.2.2 盐胁迫
1.3.2.3 温度胁迫
1.3.2.4 矿质营养胁迫
1.3.3 番茄对综合胁迫的耐受性
2 番茄的遗传和基因组资源
2.1 番茄的遗传资源
2.1.1 番茄的起源及其野生种
2.1.2 番茄的种质资源库
2.1.3 番茄的突变体库
2.2 番茄的分子标记、基因和QTL
2.2.1 番茄分子标记的发展
2.2.2 番茄数量性状QTL
2.2.3 番茄表型解析专用群体库
2.2.4 番茄抗病基因与QTL
2.2.4.1 番茄抗病基因与QTLs资源的发掘
2.2.4.2 番茄抗病基因与QTLs的染色体分布
2.2.4.3 番茄抗病基因与QTLs的分子基础
2.3 番茄的基因组资源
2.3.1 番茄参考基因组序列
2.3.2 番茄基因组重测序
2.4 番茄的SNP标记
2.4.1 番茄SNP的发现
2.4.2 番茄SNP微阵列芯片
2.4.3 番茄基因型填充
2.5 番茄的遗传多样性分析
2.6 番茄中已克隆的基因和QTL
2.7 番茄新的基因和QTL鉴定
2.8 番茄全基因组关联分析
2.8.1 番茄全基因组关联分析的条件
2.8.2 番茄全基因组关联的Meta分析
2.9 番茄非生物胁迫耐受性的遗传解析
2.9.1 番茄基因型与环境互作（G×E）的遗传调控
2.9.2 番茄嫁接对胁迫耐受性的影响
2.10 番茄组学分析
2.10.1 番茄代谢组学分析
2.10.2 番茄转录组学分析与eQTL定位