第一章“宋代龙冈书院”主要以书院文化为中心,探讨陈祥道、陈旸少年读书事迹与学术成就,并结合书院教育、书院祭祀文化进行论述,力求揭示“二陈”学术文化与书院礼乐文化关系。第二章“朱熹与梅溪书院”涉及朱熹在福州行迹、朱子闽清题刻、闽清籍朱门弟子和相关传说故事等,并期从中推求朱熹学说对闽清的影响。文泉书院是福州著名书院,故本书第三章“文泉书院的前世今生”侧重于对文泉书院的研究,在所掌握资料基础上,分为崇文书院建立、文泉书院教育思想初探、文泉书院山长、文泉书院历史沿革四个板块,以叙述该书院历史与文化。第四章“书院拾零”中,鹿坂书院篇主要探讨环境与书院、家族与书院的关系;文笔书院篇通过存世《文笔书院记》与文笔书院讲学者鄢韶成生平事迹,解说书院历史;云龙书院今演变为金沙学校,可惜该书院史料稀少。由是之故,将三书院合为一章,此亦篇名“拾零”由来。学界把外国人兴办的学校称为教会书院,以区别于本土传统书院,第五章“黄乃裳与教会书院”主要利用黄乃裳研究论文及有关教会学校著述,并结合清季书院发展史,对黄乃裳教育事迹及思想作简要介绍。观照一个地方历史不应局限于本地,当以宏观视角切入。在“书院名人轶事”章,钩沉、整理相关资料,其中包括闽清书院人物、闽清人与书院教育、闽清私塾人物等内容,以尽可能使闽清书院历史文化更加完整。私塾、文庙与书院尤有关联,故特设一章,浅论私塾、文庙与书院的关系。