《北京大学图书馆藏日本版古籍书目(套装上下册)》的收录范围是北京大学图书馆收藏的,2018年以前见于编目着录的相关日本版古籍。具体地说,日本版古籍既包括由日本翻刻的中国汉籍,即和刻汉籍,亦称和刻本(含日本人的增注本),也包括日本人用汉文或假名撰写的着作。《北京大学图书馆藏日本版古籍书目(套装上下册)》共收日本版古籍计2978种(不含丛书子目),并以传统的四部分类法编排,略作调整,设经、史、子、集、丛五类,其中计经部419种、史部571种、子部1529种、集部448种、丛部11种。其下设二级类目,二级类目收书非常多的是释家类,计517种,其次是医家类,计326种。每类条目按中文拼音音序编排,以利读者在每类下按音找书。