《资源环境税费改革问题研究》的主要创新点可以归纳为以下几点:(1)设计资源税政策调整方案,并提出资源税政策分析的框架。在相关研究的基础上,该书分析了资源税政策发展历程和目前存在的不足,从资源税税负和资源补偿两个方面设计资源税政策调整方案;为有效分析资源税政策调整的影响,该书提出“因素分析-模型构建-模拟分析和评价”的资源税政策分析基本框架。(2)构建资源配置世代交叠模型,分析资源税政策调整中主体行为和因素。基于跨期均衡思想,该书构建资源配置两期世代交叠模型,分析资源税政策调整过程中生产者、消费者和政府的跨期均衡行为,并重点分析资源税调整中各主体行为的跨期均衡以及均衡中的相关因素。(3)构建资源税政策调整模拟分析模型,并模拟分析资源税政策调整影响。基于可计算一般均衡理论,该书将资源税政策调整的相关因素纳入一般均衡分析框架中,构建资源税政策模拟分析模型,并编制扩展的社会核算矩阵作为模型分析的基础数据,在此基础上,对资源税调整方案中的资源税税率调整和资源补偿进行模拟分析,并提出相关政策建议。