宋元时期是市舶制度蓬勃发展的阶段。关于海外贸易管理的财政制度十分健全。在征税方面,市舶制度中包含了纳税人、征税对象、税率、减免税和税收处罚等绝大多数现代税制的基本构成要素。市舶制度中的税收管理也较为缜密,一方面注重税收的行政管理,另一方面注重税收的征收管理。宋代还有禁榷和博买的制度。禁榷制度一方面肃清沿海地区官商牟利的乱象,另一方面使官府牢固掌控海外贸易利润。市舶司博买的舶货一部分供皇室贵族享用,一部分由官府加价出售获取利润。这两项制度更大程度上保证了财政对海外贸易财富的汲取能力,但这两个制度也出现了诸多弊端,宋人对此就有颇多争论。元代取消了禁榷和博买的制度,统一征税,财政征收制度更为公开、规范和简化。宋元时期市舶制度为何会具有持久的生命力,究其原因是该制度产生了较为积极的社会效应、经济效应和财政效应。在社会效应方面,官府与海商在利益的共赢与争夺中寻求平衡,从而维持王朝的统治。在经济效应方面,宋元时期江南和沿海地区的商品经济发展迅速,其经济结构也出现很大变化,《基于财政视角的中国古代市舶制度研究》分析了宋元时期明州和镇江的税收结构状况,并对比各区域的商税结构,为区域经济结构变化提供了直观的证据。此外,新兴市镇的崛起及人口的变化也体现了海外贸易的积极效应。在财政效应方面,市舶制度的收益大于成本。市舶制度的收益由有形收益和无形收益构成,市舶制度的成本包括经济成本、行政成本和社会成本。经过收益一成本分析可知市舶制度是值得鼓励和推广的制度。