一、药有畏恶反使，每品下先为标明，令人开卷了然。
　　二、药有主治，详载首条，使用之者得其直达之功。
　　三、药独入一经，以治一病，亦随佐使而治百病。今着配偶于主治之后，使知寒热攻补，变化无穷，苟能触类旁通，运用自然入妙。
　　四、药分优劣。近时用药，但论某药治某病，不知名同实异，功效悬殊。兹特详加论辨，俾取资者有所考证。
　　五、药有制法，制得其宜，性味功用为之变化。今备采雷公炮制法详载于后。
　　六、药有利必有害。特载禁忌于后，庶使触目惊心，不敢轻试。
　　七、用药治病，取其相制。每有百药不治之症，而一物足以疗之，此物之相制也。爰附怪症于各条之后。
　　八、药有随处可得而罕用者，如李根白皮、萱草、水芹之类，斟酌尽善而备采之。然亦有所考据，非敢妄为也。
　　九、从本草纲目为准绳，分为二十五部，共计六百五十种。水、火、土、金、石八十五种为卷一，山草、芳草八十一种为卷二，隰草、毒草九十九种为卷三，蔓草、水草、石草、苔草六十二种为卷四，谷类、菜类七十四种为卷五，果类五十种为卷六，木类、竹类、服帛类八十二种为卷七，虫类、鳞类、介类六十七种为卷八，禽类、兽类四十种为卷九，人部十种为卷十。