有很多天才，他们几乎永远被看衰。巴赫是看衰天才总代表。他几乎从未是领导和前辈的第一选择。上任六年，莱比锡所有的权力机关——教监会、教区牧师、大学校长和市议会集体看衰巴赫。

巴赫从未献身宗教。献身宗教的人不能挑剔教堂。巴赫显然只献身音乐，因此，他对集体看衰的回答是：此处不留爷，自有留爷处。处处不留爷，爷当个体户！

当初，十五岁巴赫在岚堡学习时恰逢管风琴制造大师何若白大修教堂的管风琴。少年巴赫下课后除了给富学生擦鞋挣钱就是蹲在一旁看何若白工作。他居然就看成了管风琴验收师，并立刻在江湖上恶名远扬：他验琴必用双手双脚同时打开管风琴所有的音栓以检验风箱缺陷，此即著名的“肺验”。肺验复杂且需坚强体力，但管风琴的问题一览无余，巴赫凭此成为甲方首选和管风琴制造界公敌。

1703年，建城近千年的亚昂新教堂落成十八年后，其管风琴经大师温耀福四年努力终于完工。亚昂乃爱尔福特旁一座小镇，基督教高地，三千八百居民，竟然有三座教堂！

当时，验收管风琴，是技术难点，也是政治大事。

西方音乐史上，器乐一直附属声乐。巴洛克时代管风琴脱离声乐独立发展，此即器乐独立日。

管风琴（Organ）是欧洲历史最长的乐器之一，产生于公元前二百年，也是世界音乐史上体积最大、重量最大，构造最复杂、音域最宽广、气势最磅礴的乐器，它由许多大小、形状、粗细和材质不同的管子组成，每根管子发一个音，由脚踏板控制升降音，乐师用手脚操作键盘与脚踏板，让风箱将空气压入管子，以此发音。管风琴是典型的独奏和声乐器，很少用于管弦乐队和交响乐团，主要用于教堂礼拜，由唱诗班伴唱。

历史上最大的管风琴高度超过十米，包括三万多根音管和七层键盘，能发出当时所有乐器的声音，虽是独奏，但其音域、音色和音量与一个大型管弦乐队不相上下。罗曼·罗兰描写克里斯朵夫第一次听见管风琴时说他“一个寒噤从头到脚，好像受了一次洗礼。”这正是管风琴的妙用：它是纯粹的宗教乐器。巴赫在其《风琴小唱》（Oragelbuechlein）扉页上亲笔写下“仅为崇奉至高上帝——使至亲从中受到教益”，即是这个意思。

管风琴是典型的巴洛克乐器。“巴洛克”一词源于葡萄牙语“Barocco”，意为“形状怪异的珍珠”，用来贬称十七世纪意大利的建筑和雕刻艺术，后转指文艺复兴之后、古典音乐之前的音乐。巴洛克音乐充满华丽的装饰音，旋律精致，格式严谨，高贵庄重，气势雄浑，把感情掩盖在精美工整的技术之下，喜怒哀乐一律犹抱琵芭半遮面，不像贝多芬和莫扎特音乐那样有明显的旋律线。巴洛克音乐普遍使用数字低音记谱法，因此又称“数字低音时代”。巴赫称数字低音“是音乐最完美的基础，若以双手演奏时，左手弹奏着乐谱上的音符，右手即添加上谐和音与不谐和音，用如此美妙的和声彰显上帝的荣耀。数字低音也像所有音乐一样，其目的除了彰显上帝的荣耀和调适精神外，别无他图。”

因为基督教，巴洛克成为管风琴的黄金时代。当时德国管风琴演奏大师有北派佛莱芒的斯威林克（Sweelinck）及其学生帅特（Scheidt）与毕迪西及其学生彪姆，南派有弗罗堡。

管风琴是教堂音乐之王，巴赫是管风琴之王。空前，而且绝后。他的作品分为宗教管风琴曲（圣咏）和世俗管风琴曲（众赞歌、幻想曲、前奏曲、变奏曲、赋格、托卡塔和帕萨卡利亚）。他还分别为管风琴与羽管键琴作曲，这在键盘乐器还未分家的时代非常少见。

巴赫生前以管风琴演奏闻名。他首创五指并用的演奏方法，用脚踏板演奏也是他的独门功夫，他甚至有一部完全用脚踏板演奏的管风琴曲，其效果酷似无伴奏大提琴，据说是即兴演奏时被人记录下来的。1714年底，巴赫到卡塞尔为弗里德里希王子演奏管风琴，后来有人回忆：“他的脚插翅般掠过管风琴脚踏板，轰鸣随之奔雷也似响遍教堂。王子对巴赫的奇技叹为观止，一曲既毕，余音尚在绕梁，便脱下钻戒赐予巴赫。试想，巴赫熟练的脚就值一枚钻戒，那亲王又将以何物去奖励他的手呢？”