孔祥熙与联大先后发生两次纠葛，联大同学名之曰倒孔运动。这是近年来学生运动的先声。

太平洋战事爆发后，香港危在旦夕，留居香?的党国要人和文化界名流被困无法脱身，孔祥熙竟以飞机抢运老妈子和洋狗，一时舆论喧哗，而沉闷已久的联大同学尤感愤恨。本来，这事如果是别的要人干的，或不至掀起轩然大波，然而发生在集贪污，腐败，反动和愚蠢于一身的孔祥熙身上，怎能不令人对数年来腐败政治的愤懑，来一次总发泄！

先是，有国民党党籍的两位同学在校门口贴出“喊”壁报，详述飞机运洋狗之事，全校为之喧嚷。接着有一“响应”壁报出现，继“响应”之后，各系会，学会，级会，同学会都有响应的启事，不到两小时，新舍里头尽是打倒孔祥熙的口号标语，和有关时局的报导，如此鼓噪了两天。到第三天上午，住在昆华中学的一年级同学在全体必修的中国通史班上提出游行的主张，而且立刻整队向新校舍出发。新舍同学随即全体自动在图书馆前集合，经过十几分钟的讨论，决定上街游行。事先没有游行的准备，在几分钟内，同学们拿了自己的白被单做旗帜，各人掏出钱来沿街买粉笔写标语。事情发展之快真是出乎意料之外，蒋梦麟和梅贻琦两校委闻讯，也跟着队伍上街。游行队伍到街上时，有中法大学和几个中学及小学的同学参加，游行以后，全体大会决定通电声讨孔祥熙，要求政府改良政治。同学们的热情一直维持下去，可是没有?全的组织，至第四天以后，三青团的同学受到长官的训斥，一反其原来态度，从中阻碍事情的进行；另一方面，康泽从重庆飞来，伸出一只阴暗的巨手，造成恐惧。而现任行政院秘书长蒋梦麟校长声色俱厉的从正面劝说同学停止活动。于是这一运动就无声的结束了。

事后，康泽把昆明的特务阵容重新布置一番，还传出一张黑名单，据说因联大常委的力阻，才没有捕人。数日后，蒋夫人来昆，在云大召集两大学同学训话，首先说明她的姐姐如何廉洁，俭朴，从来不养狗，甚至看着狗就害怕云云。接着大大的训斥同学们一通。

一九四四年三月，联大一九四四级的同学已全部征调受译员训练，孔祥熙适于其时为调停蒋宋家的纠纷，继蒋夫人匆匆来昆。译训班当局向同学们宣称孔院长定于某日亲自来班慰劳，并令同学们忙着整理了一天内务。届时，忽接命令饬学生会同联大及云大全体同学往云大听训，所谓亲自慰劳云云已改为“听训”了！同学们在军事教官强迫下，整装赶到云大。不料，到云大以后，译训班的同学被摈弃在讲堂以外，站着等了半小时，还不见孔祥熙的影踪，及孔博士驾到，同学再也抑不住愤恨之情。

“打倒贪官孔祥熙！”有人是这样吼了。

“你看他胖得像猪一样！”有些人当面指?他说。

在讲堂内外一片喊叫和嘘声之中，孔祥熙还厚着面皮爬到台上大讲其祖宗孔子之道，说他是孔子的七十几代后辈，他们孔家从来不想做官，可以以他为证，他之所以在政府中任职，实在是不得已。他又说青年看事，常常只受到别人的宣传便乱说一顿，希望大家以后看明白了事实真相再下判断，要理智一点，不要受别人利用……同学们啼笑皆非，更有力的嘘起来。当时蒋梦麟氏幽默地说：“因为同学们都想瞻仰孔院长的风采，有些人看不到院长，所以秩序乱一点。”

事后，译训班同学受班主任训斥一顿，班务实际负责人吴泽霖教授泪眼双流地说：“你们叫我如何得了！”盖吴氏正当飞黄腾达时也。

纵观两次反孔运动，都是激于热情，而毫无组织，结果，孔固未倒，同学反吃了大亏。但同学们也得到了一个教训：学生运动是不能没有组织的。