送走传旨差官，左宗棠对着一班幕僚大声说道：“这是哪个大老给上头出的好主意？筠仙与本部堂是同里又是一榜同年，他与瑞麟不和，本部堂回避犹恐不及，怎么反倒要本部堂出面访查此事？这不是害筠仙吗？筠仙所陈各件都是事实，若本部堂据实覆奏，瑞麟必诬本部堂以私情废公论也。其实，广东之弊端，筠仙已几次函告于本部堂，本部堂没想到两个人闹到这么僵！筠仙官运一直不顺，总算做到了一省封疆，偏偏又碰着了瑞麟这个死对头！”

左宗棠连夜拟就《请将访查事件另派员查办》一折。

在折中，左宗棠先谈了一下自己对郭嵩焘所参瑞麟各款的看法，称：“郭嵩焘所陈数误，自系实在情形。”接着又讲了一下郭嵩焘的为人：“郭嵩焘勤恳笃实，廉谨有余，而应变之略非其所长。”最后才道：“臣于郭嵩焘生同里闬，且与臣胞兄儿女姻亲，应请回避。伏恳简派妥员查办以昭核实。”

左宗棠无论如何，都不能去趟这浑水。

折子拜发的当日，左宗棠又给郭嵩焘急函一封。

函曰：“至粤东贻误各节，尊疏已详，但言之未尽也。督于抚虽有节制之义，然分固等夷，遇有龃龉，应据实直陈，各行其是，唯因争权势相倾轧则不可耳。老兄于毛寄耘，心知其非，而不能自达其是，岂不谓委曲以期共济，而其效已可睹。兹复濡忍出之，迨贻误已深。而后侃侃有词，则已晚矣。谕旨敕就近查办，已将同里而兼婚姻之故，请旨回避。至贻误各节，则彰明较著，无待察访也。计此书到时，必已奉明谕及之，故不必有所隐匿。弟自揣疏狂婞直，久不见谅于人，行当自陈，以避贤路。唯所事未了，不得不婆娑以俟耳。”

朝廷很快下旨照准所请，着左宗棠离粤回任。但左宗棠寄给郭嵩焘的这封书信，却大大地伤了郭嵩焘的自尊。

郭嵩焘读罢左宗棠的信后，竟将信猛掷桌面，随即拍案而起，对着一班幕僚冷笑道：“本部院的这个同里，把官做到了总督，竟然也学会教训人了！”

郭嵩焘当日回到书房后，连夜秉烛给剿捻前线的曾国藩写信。在信里，郭嵩焘说了许多对左宗棠不满的话。曾国藩阅信之后，默然无语。

左宗棠于同治五年（公元1866年）刚出正月即开始班师还福建，途中，收到总理衙门建字第十二号咨文，称：“以英国阿使欲中国雇借外国轮船缉拿海盗一节，已照会各国允办，属即函商李鸿章酌筹购买，一面先行雇觅，将各口应用轮船若干，并水手、兵丁、炮械以及控制、训练、旗号各项，妥议章程具复。”

左宗棠未及将咨文读完便连连说道：“这个阿礼国，他占不到大便宜是不肯罢休啊！说什么雇借洋船缉拿海盗，雇哪国的轮？借哪国的船？还不是他英国的！不行！本部堂一定上书总理衙门，劝阻此事！”

左宗棠与徐宗幹函商后，上书总理衙门，指出：“就局势而言，借不如雇，雇不如买，买不如自造。而自造一层，虽已商议及之，尚未能确有把握，应俟有端绪，再行奏咨办理。”

开厂造船

同治五年（公元1866年）五月十三日，左宗棠抵达福州；同一天，左宗棠接到官报，云：“谕准郭嵩焘开缺回籍养疾，实授瑞麟两广总督，广东巡抚着蒋益澧补授。”

左宗棠默然无语，心里却极为郭嵩焘鸣不平。很显然，郭、瑞之争，瑞是赢家。朝廷论满汉不论曲直，这让左宗棠大为不解。

进总督衙门后，左宗棠当天没有办公事，而是在上屋与妻妾儿女们说了一天的话，来见的属员也都被门上挡了驾。

左宗棠统军入粤不多几日，老夫人诒端便染病在床，至今不能走动。长子孝威因从京师回福建途中感了瘟疫，加之回来后一直料理母亲的身体及府中各事，也已病倒多日。次子威宽因要参加乡试，不敢多问家事亦不能为长兄分忧。三子孝勋只有十四岁，四子孝同亦不过十岁，两人都在塾馆读书，都在需人照料之列。