白山黑山两派之争

”和卓“是波斯语的译音，原意是”圣裔“，后来对伊斯兰教学者和大阿訇均尊称为”和卓“。清朝的官方文书，在”和卓“之后加了一个”木“字。这”木“字，原为称呼时的语尾。

大小和卓的祖先，早年自中亚来南疆传播伊斯兰教，自称和卓，深受察合台汗后王拉什德汗崇信，其后代世称和卓，形成白山与黑山两派，争斗不休。察合台汗后王支持黑山派，把白山派领袖阿帕克和卓驱逐出南疆。阿帕克和卓向北疆蒙古准噶尔部求援，准噶尔部首领噶尔丹派军进据南疆，并把察合台汗后王迁到伊犁，而令阿帕克和卓作为傀儡统治南疆。阿帕克和卓死后，两派斗争又起，准噶尔部再次出兵南疆，尽俘两派和卓后人迁往伊犁。到了策妄阿拉布坦父子统治准噶尔部时，白山派和卓玛罕木特被禁锢于伊犁，后在伊犁生了两个儿子，长子叫波罗尼都，幼子叫霍集占，即大小和卓。

乾隆二十年（公元1755年），清军平定了新疆准噶尔部达瓦齐叛乱分裂势力。五月，清军攻克伊犁时，白山派和卓玛罕木特已死，清政府释放了他的两个儿子：大和卓波罗尼都、小和卓霍集占。波罗尼都率领他的弟弟霍集占等三十多人投奔清朝军队。伊犁平定后，清朝命令大和卓返回南疆，利用其家族的传统影响，招抚旧部，统领维吾尔民众，以实现对南疆的和平统一。大和卓返回叶尔羌（今莎车）统领回部，小和卓留伊犁掌管伊斯兰教务。波罗尼都在清军的支持下迅速占领南疆，击败黑山派和卓政权，黑山派和卓势力从此退出政治舞台。波罗尼都在收复南疆后立即宣布，天山南路从此进入”可汗秦（指清朝皇帝）的时代“。

大小和卓叛乱

公元1756年，小和卓霍集占参与卫拉特蒙古辉特部首领阿睦尔撒纳阴谋发动的叛乱，兵败逃到南疆叶尔羌大和卓处，并煽动大和卓波罗尼都背叛清朝。

乾隆二十一年（公元1756年）夏历九月，清廷派蒙古人副都统阿敏道赴南疆”慰抚“。阿敏道带领三千名厄鲁特兵、一百名索伦兵途经库车，那时候小和卓也在那里。小和卓骗他说：”我们与厄鲁特人有仇，请你遣走三千厄鲁特兵，我们欢迎你入城。“阿敏道依言照办，遣还厄鲁特兵，只带了一百名索伦兵进城。结果，阿敏道和这些索伦兵成了小和卓的俘虏，被拘禁于库车。

乾隆二十二年（公元1757年）夏历三月间，阿敏道听说小和卓要杀掉他们，就率部杀死看守他们的三十多个士兵，步行逃出。小和卓立即派三百人追上他们，将阿敏道等一百多人全部杀死，并在库车打出巴图尔汗旗号，抗拒清军。

大和卓波罗尼都受到鼓动，随后发动了武装叛乱，史称”大小和卓叛乱“。他们号召各城起兵反叛中央政府，很快集众数十万，控制了天山南路的大部分地方。

叛乱时期，大小和卓巧取豪夺，横征暴敛，对广大新疆人民施行残酷的政治压迫和经济剥削，其下属也趁机对人民群众敲诈勒索。他们所到之处大肆烧杀强掠，使许多人家破人亡，纷纷逃离家园。在大小和卓叛乱期间，南疆地区的人口大量流失，生命财产蒙受巨大损失，经济遭到严重破坏，人民群众的生活陷入困境。

平叛开始了

乾隆二十三年（公元1758年）夏历二月，清政府命雅尔哈善为靖逆将军，率满、汉兵万余自吐鲁番进发，进入南疆平叛。起初，清军出师不利。但由于大小和卓残酷地压迫、掠夺维吾尔族人民，人民苦不堪言，大小和卓得不到人民支持，很快形势就发生了逆转。

五月，清军把叛军围困在库车。大小和卓率万余鸟枪兵自叶尔羌经阿克苏赴援，被清军击败，旋即率残部入库车固守。此时，原受大小和卓煽惑的库车以西的回部诸城，多在其城主率领下投向清军。雅尔哈善未乘胜进击，疏于戒备，致使大小和卓趁夜率四百骑逃遁，雅尔哈善因贻误军机被革职。清军攻克库车后，小和卓逃到阿克苏，守城维吾尔族人闭门不纳，只得逃到乌什，同样为乌什维族人所拒，只得逃归叶尔羌。大和卓则返回喀什噶尔（今喀什），大小和卓相约各守一城，互为犄角，以作最后的抵抗。

十月，清政府另派刚平定准噶尔部的定边将军兆惠率军南下进剿。兆惠率步骑四千人至叶尔羌，三战三胜，但由于兵力较少，无法攻下城来，于是转移到城东黑水河边安营扎寨，等待援军。叛军一万多人包围了清军的黑水营，用炮轰、水淹、偷袭等方式频繁攻击。清军坚守三个月，伤亡甚众。

乾隆二十四年（公元1759年）正月，清政府命定边右副将军富德率兵三千人自乌鲁木齐驰援，至呼尔满（今莎车东北），与叛军骑兵五千激战四五个昼夜，最终获胜，渡叶尔羌河，兆惠得知援军到了，于是率兵突围，黑水之围遂解。清军会师后回到阿克苏。

六月，兆惠和富德各率兵1。5万分别攻打喀什噶尔和叶尔羌。兆惠统军自乌什进攻喀什噶尔﹐富德领兵由和阗直取叶尔羌。大小和卓见大势已去，大肆掠夺城中财物后率部弃城南逃，越过葱岭西遁，逃往帕米尔。清军追至伊西洱库尔淖尔，将叛军围在山岭上，叛军纷纷下山投降，共计有1。2万多人。

七月，大小和卓带着妻孥旧仆三四百人逃奔巴达克山（今阿富汗东部）。清军派人与巴达克当地部族交涉，八月，大小和卓被巴达克山部首领执杀，尸首送交给了清军。

大和卓对听从小和卓煽动背叛清朝十分懊悔，临死前留下遗言说，死后决不允许把他的尸体和小和卓埋在一起。

在南疆人民的支持下，清军终于粉碎这次叛乱，重新统一了新疆地区。此后，清廷加强了对天山南北的统治。

19世纪上半期，不甘于失败的和卓后裔先后发动了多次叛乱，均以失败而告终，给各族人民造成了巨大的危害和灾难。